副作用
β-內酰胺類抗生素的副作用包括：腹瀉、頭暈、疹塊、蕁麻疹、重疊感染（包括念珠菌）（Rossi，2004年）偶爾β-內酰胺類抗生素還會導致發燒、嘔吐、紅斑、皮膚炎、血管性水腫和偽膜性腸炎（Rossi，2004年）
β-內酰胺類抗生素與β-內酰胺酶抑制劑同時使用時注射處往往會疼痛和發炎。
過敏
約10%的病人對β-內酰胺類抗生素產生過敏。約0.01%的病人會發生過敏反應（Rossi，2004年）。約5-10%的病人對青霉素衍生物、頭孢菌素和碳青霉烯類抗生素產生交叉敏感。不過不同的學者對這個結論質疑。
雖然如此假如一個病人對一種β-內酰胺類抗生素已經顯示過重過敏反應的話，在給他使用其它β-內酰胺類抗生素時必須慎重考慮。