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  • 發布時間:2019-04-10 18:09 原文鏈接: 一種簡單實用的提取植物DNA實驗

    實驗方法原理的提取是植物分子生物學和基因工程研究的一種基本的技術,至今已有了數種方法。此方法最大的特點是:將SDS同時用作細胞膜的去污劑和蛋白質的變性劑,變性的蛋白質通過離心而不是酚抽提除去,使得整個操作過程變得簡單快捷,比較溫和,1小時左右就可以獲得純化的植物DNA。用這種方法得到的DNA能直接被限制性內切酶酶解,純度較高,適用于分子生物學的研究。本實驗的目的是掌握DNA提取的原理和方法。
    實驗步驟

    一、材料與方法:

    1、植物材料:螺旋藻(Spirulina platensis)、水稻(Oryza sativa)和煙草(Nicotianatabacum).

    2、試劑和溶液:

    (1)20×SSC:3mol·L-1檸檬酸鈉,pH8.0:

    (2)溶菌酶、10μg·μl-1Rnase、10%SDS(均為Sigma產品);

    (3)酚:氯仿:異戊醇=25:24:1

    (4)TE:10mmol·L-1Tris-HCL、1mmol·L-1EDTA,pH7.6。

    3、提取步驟:

    收集對數生長期的螺旋藻細胞,懸浮于5倍體積(v/w)含2mg·mL-1溶菌酶的20×SSC中,室溫保持10分鐘,偶爾搖動混勻。水稻幼苗和煙草嫩葉在液氮中研磨成粉狀后,立即用5倍體積的20×SSC懸浮,并輕輕拌勻。上述懸浮液在冰上先放置3分鐘,然后加入10% SDS至終濃度為2%,混勻;繼續放置10分鐘后,在4℃用11000×g離心15分鐘。上清液轉移至新的離心管中,并用相同體積的TE稀釋,再加入RNase至終濃度為10μg·ml-1,室溫放置30分鐘。11000×g離心15分鐘,所得的DNA沉淀用70%的乙醇洗兩次后,真空中抽干或自然干燥,最后溶于適量的TE中。

    二、結果與討論:

    利用本方法,從煙草、水稻和螺旋藻中提取了DNA。因為整個過程的操作步驟較少,也較溫和,減少了DNA被弄斷的機會,所以所得的DNA分子量較大,大部分都比完整的λ噬菌體的DNA(48.5Kb)還大。另外,用此方法所提的DNA的OD260/OD280的比值1.8至1.9之間,并能被限制性內切酶酶切,顯示有較好的純度。

    在使用本方法時,須注意下面的幾個問題。當20×SSC的懸浮液中加入SDS至2%后,溶液中會出現白色絮狀物質,表明蛋白質已經變性,這是本方法的主要特點之一。它通過變性后離心而不是常用的多次酚抽方法,將絕大部分的蛋白質除去。離心所得的上清液,需要用TE稀釋,這是因為溶液中的鹽濃度較高,如不稀釋,RNase就無法起作用;而且在沉淀DNA時,如用乙醇會將溶液中的鹽析出,如用異戊醇則形成兩相的界面,將溶液中鹽的濃度降低后,就解決了這些問題。但是,加大稀釋TE的體積,對于DNA的產量并無非常明顯的作用,用等體積的TE稀釋即可。DNA抽提液經RNase酶解后,再用酚:氯仿:異戊醇抽提一次,用以除去剩余的蛋白質和酶。本方法適用于大量和微量的DNA制備。大量制備時,RNase酶解和酚:氯仿:異戊醇的抽提步驟可以在DNA濃縮一些后再使用,這樣就較便于操作,并且節省RNase和酚。通常,用這種方法能從每克新鮮組織中提取到10至15μg的DNA。

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