1974年Golafield 首先報告輸血后非甲非乙型肝炎。1989年英國科學家邁克爾·侯頓(Michael Houghton)和他的同事們測出了病毒的基因序列，克隆出了丙肝病毒，并命名本病及其病毒為丙型肝炎（HepatitisC）和丙型肝炎病毒（HCV）。由于HCV基因組在結構和表型特征上與人黃病毒和瘟病毒相類似，將其歸為黃病毒科HCV。
2017年10月27日，世界衛生組織國際癌癥研究機構公布的致癌物清單初步整理參考，丙型肝炎病毒（慢性感染）在一類致癌物清單中。
