大多數MAPK具有許多共同的特征，例如依賴于兩個磷酸化事件的激活、三層通路結構和類似的底物識別位點。這些是“經典”的MAPK。但是，也有一些古老的“離群”激酶，它們不具有雙重磷酸化位點，僅形成兩層通路，并且缺乏其他MAPK所需的底物結合特征。這些通常被稱為“非典型”MAPKs。還不清楚這些非典型MAPKs是否形成與經典MAPKs相反的獨立群體。
