低分子肝素（LMWH）是一類抗凝藥物。它們用于預防血栓和治療靜脈血栓栓塞（深靜脈血栓形成和肺栓塞）以及治療心肌梗塞。
肝素是一種天然存在的多糖，可抑制凝血，即導致血栓形成的過程。天然肝素由不同長度或分子量的分子鏈組成。不同分子量的鏈，從5000到超過40,000道爾頓，構成多分散的醫藥級肝素。相比之下，LMWH僅由短鏈多糖組成。低分子肝素被定義為平均分子量小于8000Da且所有鏈中至少60%的分子量小于8000Da的肝素鹽。這些是通過聚合肝素的各種分級或解聚方法獲得的。
來源于天然來源的肝素，主要是豬腸或牛肺，可用于治療性地預防血栓形成。然而，天然肝素或普通肝素的效果比低分子肝素更難以預測。