卵磷脂生產一般采用以下幾種工藝：
乙醇萃取：原理是卵磷脂溶于乙醇，其他磷脂：腦磷脂、肌醇磷脂不溶于乙醇。
層柱析法：原理是吸附劑對腦磷脂、肌醇磷脂、卵磷脂的吸附能力不同。
Co2超臨界萃取：原理是超臨界點Co2與卵磷脂異常平衡行為和傳遞性能。在改變溫度和壓力的情況下分離出不同組分。
膜分離法：原理是利用不同卵磷脂、腦磷脂、肌醇磷脂在不同溶劑下形成不同的分子質量加以分離，如用溶于乙烷-異丙醇混合溶液的磷脂溶液通過聚丙烯半透膜，可使卵磷脂含量由25%提高到51%，回收流過膜的溶液并回收，可大大提高卵磷脂的純度。但是此方法不很成熟，并不能區分分子量相近的組分。目前僅限于實驗室。