1.除一般尿常規檢查外，尿沉渣涂片革蘭染色作細菌檢查，必要時作1h尿細胞排出率測定(方法：排空膀胱，收集3h清潔尿，計算出1h尿白細胞及非鱗狀上皮細胞數。判斷：30萬有診斷意義)。此法較12h尿沉渣計數法準確。
2.清潔中段尿行細菌培養、菌落計數及藥物敏感度測定，革蘭陰性桿菌菌落計數10萬/ml者有診斷意義，1萬～10萬/m1為可疑，1萬/ml者即有診斷意義。革蘭陽性球菌菌落計數100～10000/ml即應考慮感染。
3.特殊培養及檢查。對于常規細菌、真菌培養未能發現致病菌時，可采用高滲培養(0.3M蔗糖培養基)，以除外L-型細菌感染；采用厭氧培養以除外厭氧菌感染。必要時可行病毒、支原體及腐生寄生菌等檢查。
4.腎功能檢查包括腎小球濾過率測定及腎小管濃縮功能、酸化功能檢查，慢性病例尚應查血及尿鉀、鈉、氯、鈣、磷、鎂、pH、動脈血氣分析。
5.反復發作病例常規行雙腎B超檢查，酌情作靜脈腎盂造影或逆行尿路造影，必要時行CT檢查。女性應行婦科檢查，必要時行盆腔靜脈造影，以除外易感因素的存在。
6.診斷標準根據泌尿系感染發生部位常分為上、下尿路感染。上尿路感染即指腎盂腎炎，根據臨床特征，又可分成急、慢性腎盂腎炎。腎盂腎炎可伴下尿路感染，而下尿路感染常單獨存在。