此療法不僅可提高生存率，而且有可能使白血病根治。急性骨髓移植的患者常發生移植物抗宿主病（GVHD），5年內復發率也高達70%，因此大多數人主張如有條件應在第1次緩解（CR1）后進行骨髓移植。此時BMT治愈率高，復發率低；由于身體狀況尚可，耐受性強，死于并發癥者較少。但對于兒童患者，隨著大規模的臨床研究的開展，目前發現對于低危險組、且獲得首次緩解的AML患兒，采用化療而不行移植也能獲得相似的療效，對于中危和高危組AML，采用化療還是移植仍有爭論，因為移植復發率可能較低，但卻存在早期或晚期的移植相關并發癥。