可分為單鏈（變性）和雙鏈（天然）DNA抗體：
（1）抗單鏈DNA（ssDNA）抗體:在多種疾病中及正常人血清中存在，無特異性，臨床價值不大。
（2）抗雙鏈DNA（dsDNA抗體）：對診斷SLE有較高的特異性，且與SLE的活動相平行，并可作為治療的估價。隨著疾病活動的控制，抗dsDNA抗體滴度可以下降或消失。抗dsDNA抗體與DNA結合成為免疫復合物在腎小球基底膜沉積，或抗dsDNA抗體直接作用于腎小球抗原造成SLE患者的腎損害。抗dsDNA抗體陽性的患者較陰性患者發生腎炎的危險性高12倍。測定抗dsDNA抗體的方法很多，其中放射免疫法（Farr）敏感，用此法檢測其結合率>20%為 陽性，短膜蟲或馬疫錐蟲為底物的間接免疫熒光法（IF－CT或IF－TE）更特異，此法31：5可判陽性。低滴度的抗DNA抗體也可在多種疾病甚至正常人中出現。