新生兒病理性黃疸與生理性黃疸不同，根據其特點可以相互鑒別。新生兒病理性黃疸是由許多原因組成的一組疾病，常見的幾種黃疸原因是：溶血性黃疸、感染性黃疸、阻塞性黃疸、母乳性黃疸等，不同原因形成的黃疸其黃疸的特點又各不相同。
溶血性黃疸
溶血性黃疸最常見原因是ABO溶血，它是因為母親與胎兒的血型不合引起的，以母親血型為0、胎兒血型為A或B最多見，且造成的黃疸較重；其他如母親血型為A、胎兒血型為B或AB；母親血型為B、胎兒血型為A或AB較少見，且造成的黃疸較輕。這樣一來，一些父母會十分緊張，擔心孩子會發生ABO溶血，其實要說明的一點是：不是所有ABO系統血型不合的新生兒都會發生溶血。據報道新生兒ABO血型不合溶血的發病率為11.9%。新生兒溶血性黃疸的特點是生后24小時內出現黃疸，且逐漸加重。
感染性黃疸
感染性黃疸是由于病毒感染或細菌感染等原因主要使肝細胞功能受損害而發生的黃疸。病毒感染多為宮內感染，以巨細胞病毒和乙型肝炎病毒感染最常見，其他感染有風疹病毒、EB病毒、弓形體等較為少見。細菌感染以敗血癥黃疸最多見。黃疸的特點是生理性黃疸后持續不退或生理性黃疸消退后又出現持續性黃疸。
阻塞性黃疸
阻塞性黃疸多由先天性膽道畸形引起的，以先天性膽道閉鎖較為常見，其黃疸特點是生后1-2周或3-4周又出現黃疸，逐漸加深，同時大便顏色逐漸變為淺黃色，甚至呈白陶土色。
母乳性黃疸
這是一種特殊類型的病理性黃疸。少數母乳喂養的新生兒，其黃疸程度超過正常生理性黃疸，原因還不十分明了。其黃疸特點是：在生理性黃疸高峰后黃疸繼續加重，膽紅素可達10-30 mg/dl，如繼續哺乳，黃疸在高水平狀態下繼續一段時間后才緩慢下降，如停止哺乳48小時，膽紅素明顯下降達50%，若再次哺乳，膽紅素又上升。
病理性黃疸不論何種原因，嚴重時均可引起“核黃疸”，其預后差，除可造成神經系統損害外，嚴重的可引起死亡。因此，新生兒病理性黃疸應重在預防，如孕期防止弓形體、風疹病毒的感染，尤其是在孕早期防止病毒感染；出生后防止敗血癥的發生；新生兒出生時接種乙肝疫苗等。家長要密切觀察孩子的黃疸變化，如發現有病理性黃疸的跡象，應及時送醫院診治。
嬰兒剛出生可以出現生理性黃疸的，一般出生2-3天出現，4-6天達到高峰。7-10天開始消退。除了食欲不振以外，對孩子是沒什么影響的。
如果黃疸從孩子出生24小時內就有的話，并且3周都沒消退，或是退后又復發，則統統歸到病理性黃疸。
血液檢查的正常數值是：總膽紅素3.4-17.1 umol/L（0.2-1.0mg/dl）
直接膽紅素0.50-3.4 umol/L（0.03-0.2mg/dl）