腸脹氣可以是功能性的疾病也可以是器質性的疾病，其中功能性的疾病包括功能性消化不良、腸易激綜合征、吞氣癥等，器質性疾病原因很多，例如：1、胃腸疾病：胃炎、胃下垂、急性胃擴張、幽門梗阻、胃潰瘍、胃癌、糖尿病胃輕癱、小腸細菌過度生長、腸道感染、腸結核、急性出血性壞死性腸炎、腸梗阻、腸系膜上動脈綜合癥等。2、肝、膽、胰腺疾病：肝炎、肝硬化、肝癌、慢性膽囊炎、膽結石、胰腺炎等。3、腹膜疾病：急性腹膜炎、結核性腹膜炎、腹膜癌等。4、心血管疾病包括充血性心力衰竭、心絞痛、心律失常、腸系膜血管栓塞、血栓形成、腸系膜動脈硬化癥等。5、急性感染性疾病各種嚴重的感染引起的毒血癥、敗血癥、中毒性肺炎、腸傷寒等。6、其他疾病支氣管哮喘、肺氣腫、低鉀血癥、脊髓病變、藥物反應、結締組織病、粘液性水腫、營養不良以及外科手術后等。
腸脹氣具體原因可總結為以下幾類：
1、吞入空氣過多：吞氣癥、精神因素或某些胃腸道疾病可吞入大量氣體；大量飲水或進食太快時也易吞入空氣；嬰兒過度哭鬧也會吸入過量空氣。
2、腸道排空障礙：腸梗阻、腸壁張力或動力減弱時，過量氣體可積聚于腸道。
3、腸道產氣增多：小腸細菌過度生長是指遠端腸道菌群易位進入小腸，引起小腸內細菌過度生長，從而產生過量氣體可導致腹脹、肛門排氣增多等癥狀。其與腸易激綜合征、功能性消化不良、功能性腸病、肝病、克羅恩病、小腸憩室、胰腺炎、短腸綜合征、糖尿病等疾病密切相關。