分配色譜儀填充柱是填充了固定相（載體和固定液）的色譜柱。
一、柱管選擇：
1、柱管材質：
常用的填充柱有玻璃管柱、金屬管柱和塑料管柱。
（1）玻璃管柱：
1）材質：硼硅玻璃。
2）特點：化學惰性好，柱效高，易碎。
3）使用事項：使用時等柱冷卻后才能停止通載氣。
4）應用：適用于強極性化合物的分離。
（2）金屬管柱：
1）材質：主要為不銹鋼。
2）特點：不易損壞，看不見柱內。
3）使用事項：使用前用布擦凈內壁，再用10%熱過氧化氫溶液浸泡，最后用水沖洗至中性。
4）應用：適用于脂肪酸酯和烴類化合物的分離。
（3）塑料管柱：
1）材質：多為聚四氟乙烯。
2）特點：化學惰性好，柱效不高。
3）使用事項：最高使用溫度不超過260℃。
4）應用：適用于其它填充柱不好分離的樣品分離，如HCl和Cl2等。
2、柱管尺寸：
柱管尺寸規格多，以適應不同樣品分離目的、載體粒度、載氣流量和儀器的要求。
分析柱外徑有3.18mm、4.76mm和6.35mm；前兩種內徑為2mm，后一種內徑為2mm、3mm和4mm；柱長多在3m以內；柱形有U形和螺旋形，U形柱柱效較高，螺旋柱的螺管直徑比柱內徑大15倍才可獲得較好柱效。
柱內徑越小，應填裝粒度更小的固定相，才可獲得更高的柱效。但柱容量隨之減小，柱壓降隨之增大。
填充柱尺寸與載體粒度、載氣流量的關系如下：
（1）柱內徑2mm：
1）載體粒度：柱長＜3m時為100～120目，柱長＞3m時為80～100目。
2）載氣流量：N2為8～15mL/min，H2為15～30mL/min。
（2）柱內徑3mm：
1）載體粒度：柱長＜3m時為100～120目，柱長＞3m時為80～100目。
2）載氣流量：N2為15～30L/min，H2為30～60mL/min。
（3）柱內徑4mm：
1）載體粒度：柱長＜3m時為80～100目，柱長＞3m時為60～80目。
2）載氣流量：N2為30～60L/min，H2為60～100mL/min。
二、固定相制備：
制備液體固定相時，將適量的固定液均勻地涂在載體表面上，使之能很好的分散，同時覆蓋載體表面活性點。制備時溶解固定液的溶劑體積不宜過大，以能潤濕載體為宜；溶劑沸點不宜過高，以免溶劑揮發時造成固定液損失；溶劑化學性質要穩定，不與固定液發生任何作用。
三、柱填充：
1、填充要求：
（1）固定相要均勻、緊密，減少空隙和死空間。
（2）填充時不得敲打過猛，以免造成載體破碎，致使柱性能變差。
2、柱填充方法：
（1）多采用抽空裝柱，即將柱出口接上真空泵抽氣，固定相從入口傾入，還可接CaCl2或硅膠干燥塔以防潮濕空氣進人。
（2）沸點較低的固定相不宜采用抽空裝柱，一般采用邊裝邊敲打的手工法裝柱。
（3）以聚四氟乙烯作載體的固定相，需將固定相冷凍12h，然后在0℃條件下填充到色譜柱中。色譜柱的濕氣要預先用干燥氣體置換，以免色譜柱結冰，固定相結塊。
四、柱老化：
1、柱老化目的：
除去柱內剩余的溶液、固定液的低沸點餾分和易揮發的雜質，使固定液更均勻地分布在載體和管壁上。
2、柱老化方法：
柱老化多采用氣體流動法，即將柱人口與進樣室相接，出口不接檢測器，通以載氣，以2～4℃/min的速度程序升溫至低于固定液zui高使用溫度20～30℃，老化12～24h。當基線平穩后，老化合格。