基于108種樟目植物基因組及序列構建九分支系統進化樹

　　樟科（Lauraceae）是被子植物木蘭亞綱（Magnoliidae）的重要類群，約有60屬3500種，占木蘭類植物種類的三分之一。當前，樟科分類系統問題尚未解決，先前基于部分形態學特征建立的無根藤亞科和樟亞科，以及樟亞科中的厚殼桂族、鱷梨族和月桂族備受爭議。

　　為了確定樟科植物的族（tribe）界定、厘清族之間的關系，版納植物園生物多樣性研究組研究人員及其合作者利用131種植物的質體基因組和序列，成功構建了樟科六族九分支的系統結構，進一步形態學特征的統計檢驗也支持上述系統關系。基于高支持的質體基因組系統發育樹，樟目和樟科的單系屬性再次得到確認。樟目內部由蓮葉桐科（Hernandiaceae）和玉盤桂科（Monimiaceae）共同組成樟科的姐妹群，香皮檫科（Atherospermataceae）和奎樂果科（Gomortegaceae）互為姐妹群組成第三分支，蠟梅科（Calycanthaceae）形成位于基部的第四分支。壇罐花科（Siparunaceae）的系統位置因數據缺乏未能得到解決。樟科內部六族包括：棠桂族（Hypodaphnideae），厚殼桂族（Cryptocaryeae），無根藤族（Cassytheae），新樟族（Neocinnamomeae），檬果樟族（Caryodaphnopsideae）和樟族（Cinnamomeae）。其中，新樟族和檬果樟族為兩新族在本研究中正式發表，而樟族包含的種類大幅增加。樟族又可再分為綠新樟-桂土楠屬分支（Chlorocardium-Mezilaurus clade），潤楠-鱷梨屬分支（Machilus-Persea clade），樟-甜樟屬分支（Cinnamomum-Ocotea clade），以及月桂-新木姜子屬分支（Laurus-Neolitsea clade）。進一步基于形態學特征的系統發育信號檢測表明，上述系統發育關系與兩性花的分化、生活型、花序類型、子房位置、藥室數目、葉序、葉脈序、葉脈數和花序著生位置等都相吻合。至此，分子系統學的結果和形態分類性狀通過統計檢驗相互印證，樟科分類系統的骨架也已搭建完成，為后續各個屬群深入地系統分類工作奠定了基礎。

　　該研究成果以Plastid phylogenomics improve phylogenetic resolution in the Lauraceae 為題，在線發表于國際學術期刊Journal of Systematics and Evolution上。

基于108種樟目植物質體基因組及序列構建的樟科九分支系統進化樹