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  • 發布時間:2023-03-15 11:05 原文鏈接: 基因測序結果怎么看

    問題一:測序結果怎么分析 測序結果的分析
    測序都是從5端進行的,正向和反向測序是指對DNA的兩條互補鏈分別測序,通常兩個方向測序結果經校讀后完全一致才能認為得到可靠結果。生工測序結果一般都提供兩個文檔,一個是TEXT的序列文檔,一個是用Chromas軟件打開的ABI文檔。

    1.尋找引物

    blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 比對,去除引物序列,找到目的片段。
    在DNAMan上進行比對,看引物能不能比對上(一個不變,一個反向互補),如果比不上,那可能就不是你要的序列,如果能比上,上游以引物第一個為分界線,去除前面的;下有一最后一個為分界線,去除后面的,剩下的就是目的序列。然后在NCBI上Blast.就OK了。

    批注:PCR產物進行測序的結果可能不包含引物序列

    2.將找到的對應目的片段轉成*.txt格式

    3.下載BioEdit軟件

    第一:打開Bioedit軟件,導入拼接好的樣品序列與標準亞型參考序列
    File New Alignment Sequence New Sequence 導入拼接好的樣品序列和標準參考序列(從TEXT文檔利用復制粘貼工具) Apply and close 保存結果 關閉窗口

    第二:點擊菜單欄上按鈕 Accessory Application ,選擇 Clustalw Multiple Alignment

    File Open Accessory Application Clustalw Multiple Alignment

    第三:比對結束后,刪除比對序列兩端的多余序列,使所有序列等長

    選擇需要編輯的序列 Sequence Edit Sequence 進行序列的編輯 保存修改后結果

    第四:選擇 Sequence 菜單下的 Gaps ,點擊 Lock Gaps

    第五:將比對后的序列保存為Fasta 格式文檔

    4.下載MAGE4.0軟件

    1) 打開MEGA軟件,選擇 File 菜單欄中的 Convert To MEGA Format ,把序列文件的格式轉換為meg文檔保存;
    2) 雙擊序列的meg文檔,選擇 Nucleotide Sequences ,點擊 OK ;
    3) 程序運行中詢問是否為蛋白編碼序列,選擇 NO ;
    4) 在MEGA操作界面選擇 Phylogeny 菜單欄下 Bootstrap Test of Phylogeny 中的 Neibour-Joining ;
    5) 選擇 Test of Phylogeny 欄中的 Bootsrap , Replications 設定為1 000;在 Options Summary 欄中的 Model 項中,設定參數為 Kimura 2-Paramete r,最后選擇 pute ;
    6) 將分析結果采用Los Alamos HIV序列庫提供的HIV-BLAST和Subtyping工具進行驗證。...>>

    問題二:dna測序結果分析怎么看進化圖 如果是用Sanger測序的話,電泳得到的條帶是模板連的互補鏈,電泳的方向是有3‘段到5’段的,那么從下往上讀,就可以的出互補鏈,根據反向平行,就可以推倒出模板連的堿基序列。

    問題三:怎樣分析基因測序結果 1.假設你測的是一個基因的序列,如果已知這個基因的序列,則將你測序得到的基因序列與已知的序列相比對,分析看兩者在哪個地方不對應,不對應的地方即為突變的地方.比對的軟件有sequencher,或者去NCBI網站點擊BLAST進行.
    2.如果你測的是一個以前未知的序列,那么要測幾個不同的單克隆,將測得的結果進行比對,分析一致的地方以及不一致的地方.

    問題四:細菌基因組重測序結果分析報告怎么看 測序只是最基礎的,接下來你要做功能基因分析,查找確定哪一些是編碼基因的序列,然后做表達檢測。。 如果你事先知道自己的目的基因序列,測序結束后,應該可以直接找到。

    問題五:高通量基因測序檢驗報告單怎么看 哪個公司出的,可撥打他們的客服電話。從業人員素質普遍較高,可以很詳細解答您的疑問。

    問題六:如何看測序的結果與預期相差很大 先注意染色體與基因的關系,一條染色體有多個基因。
    所以基因結構變異(堿基對增、減、變)導致一個基因變。染色體結構變異,導致多個基因的重復,缺失,排列順序的改變等。所以基因突變是某一性狀改變,而染色體變異是某一系列性狀的改變。

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