近幾年來，基于單細胞測序技術的科學研究取得了突飛猛進的發展，其成果有望為一些重要的生物學問題提供新的解決方案。測序君盤點了2015年的單細胞測序研究成果，供大家查閱。
《Science》：瑞典卡羅林斯卡學院的科學家們的單細胞測序研究。該研究生成了有關皮質細胞類型以及細胞內活化基因的詳細圖譜。研究小組利用單細胞測序技術檢測了3000多個細胞，并發現了一些迄今未知的細胞類型。
Cell types in the mouse cortex and hippocampus revealed by single-cell RNA-seq
《Science》：Cellular Research公司的研究人員發明的新型單細胞基因表達檢測技術，利用細胞和分子特異性條形碼，可在成千上萬甚至數十萬細胞中一次研究大量的基因。研究論文還報告了利用這一技術獲得的來自各種類型造血細胞的數據。
Combinatorial labeling of single cells for gene expression cytometry
《Nature Communications》：華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室玉米團隊發展了一種簡單可行的方法，成功分離出玉米四分體的四個小孢子，并提取其完整DNA。首次實現了植物單細胞全基因組測序。
Dissecting Meiotic Recombination based on Tetrad Analysis by Single-Microspore Sequencing in Maize
《Genome Biology》：美國MD安德森癌癥研究中心和德克薩斯大學休斯敦健康科學中心的研究人員開發出一種新型單細胞外顯子組測序方法SNES。
SNES: single nucleus exome sequencing
《Nature Communications》：美國俄勒岡健康與科學大學（OHSU）、斯坦福大學和瓦倫西亞大學的研究人員認為，利用單細胞基因分析和無創成像的先進技術檢測胚胎，能夠在受精卵細胞發育第一階段的30分鐘內檢測到胚胎中染色體異常現象，提高體外受精成功率。
Prediction model for aneuploidy in early human embryo development revealed by single-cell analysis.Vera-Rodriguez M, et al. Nat Commun. 2015 Jul 7.
《Genome Biology》：北京大學生物動態光學成像中心研究開發出一種單細胞通用的、poly(A)-獨立的RNA測序（SUPeR-seq）方法，來測定單個細胞的多腺苷酸RNA和非多腺苷酸RNA，該方法表現出穩健的敏感性和準確性。
Single-cell RNA-seq transcriptome analysis of linear and circular RNAs in mouse preimplantation embryos.Fan X,et al.Genome Biol. 2015 Jul 23.
《PNAS》：北京大學研究人員開發出了一種基于乳液的擴增方法，來抑制擴增偏移檢測單細胞拷貝數變異（CNV），同時以高精確度檢測單核苷酸變異（SNV）。這一方法能夠與各種擴增實驗方案包括廣泛使用的多重置換擴增（MDA）相兼容。
Uniform and accurate single-cell sequencing based on emulsion whole-genome amplification. Fu Y, et al. Proc Natl Acad Sci U S A. 2015 Sep 4.
《Cell Stem Cell 》：Wellcome基金Sanger研究所和歐洲生物信息研究所（EMBL-EBI）的研究人員利用單細胞RNA測序技術，發現了參與干細胞調控網絡的新基因，以及新的細胞亞群，有助于深入了解干細胞多能性——成為幾乎所有不同類型細胞的能力。
Single Cell RNA-Sequencing of Pluripotent States Unlocks Modular Transcriptional Variation
《Nature Biotechnology》：歐洲分子生物學實驗室（EMBL）的研究人員發明了新單細胞RNA-seq方法。利用這種方法，研究“基因在一個給定組織中如何表達“的科學家們，現在可以在細胞分辨率上同時檢測成千上萬個基因。
High-throughput spatial mapping of single-cell RNA-seq data to tissue of origin
《PNAS》：斯坦福大學的研究人員對近500個成人或胎兒腦細胞進行了單細胞RNA測序。利用這種方法，能夠鑒定出大腦中所有主要的細胞類型，并確定神經元的亞型。研究人員還觀察了神經元從早期發育到后期分化階段的變化。
A survey of human brain transcriptome diversity at the single cell level
《Genome Biology》：英國威康信托基金會桑格研究所、劍橋大學、上海交通大學等處研究人員采用單細胞轉錄組分析，來解析造血干細胞（HSCs）的分子異質性。這項研究論證了單細胞轉錄學用于解析干細胞區室中的細胞過程和譜系異構性的效用。
Single-cell transcriptomicre construction reveals cell cycle and multi-lineage differentiation defects in Bcl11a-deficient hematopoietic stem cells
《Nature》：荷蘭科學家利用一種新的計算方法結合轉錄組測序，發現了小腸中一些罕見的細胞類型，這對于深入了解器官的細胞組成，探究健康和疾病狀態下的組織生物學具有重要意義。
Single-cell messenger RNA sequencing reveals rare intestinal cell types
《Nature Methods》:美國冷泉港實驗室的科學家，發表了一種新的交互式分析程序Gingko，可減少單細胞分析的不確定性，并提供了一種簡單的方法，可視化細胞群體之間拷貝數突變的模式。
Interactive analysis and assessment of single-cell copy-number variations
《Nature Methods》：一項被稱為G&T-seq（Genome and Transcriptome Sequencing）的新測序方技術，能夠實現大規模的DNA和RNA平行測序，同時展現單個細胞的基因組序列和基因活性。研究人員可以通過G&T-seq更好地理解腫瘤中的癌細胞多樣性。
G&T-seq: parallel sequencing of single-cell genomes and transcriptomes. Macaulay IC, et al. Nat Methods. 2015 Apr 27.
《Scientific reports》：南方科技大學研究人員從多個角度解析了三種最常用的單細胞基因組擴增方法。經過仔細的比較，MALBAC和genomeplex WGA4的方法在拷貝數變異檢測方面明顯優于MDA的方法。
Quantitative assessment of single-cell whole genome amplification methods for detecting copy numbervariation using hippocampal neurons