（1）代謝產物：生理性影響尿顏色主要是尿色素、尿膽素（URB）、尿膽原（URO）等。
（2）飲水及尿量：大量飲水、尿量多則尿色淡；尿色深見于尿量少、飲水少或運動、出汗、水分丟失。
（3）藥物的影響：如服用核黃素、呋喃唑酮（痢特靈）、黃連素、牛黃、阿的平使尿呈黃色或深黃色；番瀉葉、山道年等使尿呈橙色或橙黃色；酚紅、番瀉葉、蘆薈、氨基匹林、磺胺藥等使尿呈紅色或紅褐色。
（4）鹽類結晶及酸堿度等：生理性尿混濁的主要原因是含有較多的鹽類，常見有：
①尿酸鹽結晶：在濃縮的酸性尿遇冷時，可有淡紅色結晶析出。
②磷酸鹽或碳酸鹽結晶：尿呈堿性或中性時，可析出灰白色結晶。