本周的《Lancet Haematology》出版了一個概念性研究結果，這個實驗中，研究人員證明，他們能夠從被診斷為早期或者晚期的患者中的血液中的無細胞DNA中，發現霍奇金淋巴瘤細胞的基因組失衡。
非侵入性測定法，主要依賴于下一代鳥槍測序的ccfDNA，其可以用于鑒定對治療反應不明顯的患者，并提供以后總有價值的，可以使用的監控治療效果的手段。
該研究的想法來源于在魯汶大學醫學院進行的一次NIPT實驗，在該實驗中進行了全基因組拷貝數異常的檢測，在進一步的實驗中，從同一個女性患者的第二份血液樣品中，該結果得到了證實。最終，其被診斷患有早期的霍奇金淋巴瘤。
為了確定該婦女的不正常基因組譜是否與癌癥相關，研究人員對其腫瘤進行了活檢，該組織包括了惡性細胞，即所謂的霍奇金/里德-斯特恩伯格（HRS）細胞，這是通過熒光原位雜交證實的，之后發現，他們的DNA與血液中的異常DNA具有一些相同的地方。
這一發現表明，血液中的ccfDNA中的一部分是由HRS細胞衍生的，這是一個令人驚訝的發現。
根據研究的主要作者，魯汶大學的人類遺傳學系的教授Peter Vandenberghe的觀點，活檢的霍奇金淋巴瘤只有一小部分，如淋巴結重大部分是HRS細胞，而這個區域是由非惡性細胞包圍的。
“當你想要分析這些HRS細胞時，外圍的細胞將會成為主要的技術障礙和困難，”他說。“他們與其他細胞混合在一起，如果你想分析一下HRS細胞基因組的變化情況，你需要先凈化它們，但是這是費時的，而且具有技術挑戰性，最關鍵是很難。”
因為有些HRS細胞具有相同的基因組特征，這可以在血液檢測中被發現，這是可以實現，但是并不是十分困難的，這種方法有望成為一種替代HRS細胞分析的技術。
為了證實他們的發現，研究人員對另外9例患者進行了ccfDNA測序，這些人中，大多數都是近期在醫院使用Illumina HiSeq 2500的快速運行模式診斷患有霍奇金淋巴瘤的。在這些人中，7個人是早期病例，2個是晚期病例。
在8名患者中，他們發現了異常的DNA圖譜。唯一的陰性結果來源于一名早期患者，這可能是因為該病還沒有廣泛的分布于該患者體內。
他們通過FISH對患者的HRS細胞進行活檢，證明了他們的結果，他們觀察到一系列的基因區域，這些區域中反復的出現DNA譜的異常。他們發現，“在ccfDNA的基因組失衡和在所有FISH實驗相對應的染色體區域的拷貝數改變之間，存在著顯著的整體一致性。”
此外，研究人員在患者開始化療和放療后，連續幾個星期采集血樣并進行了分析，發現在大多數情況下，他們的ccfDNA圖譜恢復到正常情況都非常快。
根據Vandenberghe的觀點，對于霍奇金淋巴瘤系那個關的基因組異常的血液檢測，是有希望應用于臨床領域的，特別是在預測治療反應和治療后對疾病的檢測方面。
霍奇金淋巴瘤占所有淋巴瘤的30%，并且是青少年和年輕成年人中最常見的淋巴瘤類型。該疾病的患者進行化療后大約有90%的治愈率，但是也有10~15%的一線治療會失敗。“如果我們能在疾病的前期將可能失敗的患者鑒定出來，這將是十分有益的，這樣我們就能夠不讓他們暴露在不是十分有效的化療中。” Vandenberghe這樣說。
在一線治療中部分患者觀察到了類似的情況，這將會導致之后的毒副作用，包括導致其他類型的癌癥。“如果你想減少治療，讓我們了解到，什么樣的病人能夠在較少的治療條件下痊愈是十分重要的，” Vandenberghe說。“但是這在現在是不可能的。”
在治療后，ccfDNA譜迅速恢復正常的事實表明，其可以用于檢測治療反應，而這現在主要是通過PET/CT成像進行的。“成像是一種非常豐富的技術，但他也有一定的風險-會讓患者暴露在輻射中，” Vandenberghe說。“因此，這種新穎的血液采樣方法具有很大的潛力。”
然而，像PET/CT掃描一樣，基于學測的測序分析，依賴于基因組不同區域的測序數據，而且也不能檢測到點突變，因此是不能檢測疾病殘留的微笑痕跡的，因為它是不夠敏感的。
而其他更敏感的技術，如數字PCR，可以檢測到數量稀少的血液中HRS細胞衍生自由DNA，因此更合適尋找疾病殘留的微小痕跡。
展望未來，Vandenberghe和他的團隊計劃繼續他們的血液測試，其將對至少100例霍奇金淋巴瘤患者進行檢測，這將成為臨床實驗的一部分。收集患者血液樣品的目的在于檢測和中期以及治療結束時候進行評估，這將通過與他們疾病相關的基因組圖譜進行比較得出。“我們希望能夠建立這種新的技術，這種技術是敏感的，能夠在早期，甚至更早的階段檢測疾病，并且確定那些圖譜對于治療是有積極應答的，那些圖譜對于治療反應是不太明顯的。我們也希望看到在治療后異常圖譜消失是有多快，以及將其與PET/CT的結果進行一定的比較。”
此外，研究人員計劃探索除了鳥槍法之外的測序技術來分析ccfDNA，包括PCR，數字PCR，一把靶向測序，這些將有助于他們去尋找復發性的霍奇金淋巴瘤的突變和測量該疾病的最小殘留水平。
“該技術最大的好處是血液樣品的獲得是十分方便的，這比回到淋巴結進行活檢更簡單，也比從這些活檢組織中分離出HRS細胞簡單，” Vandenberghe說。“我們可以在很多情況下進行，因為該技術在并不需要太多的技術或者實驗室條件，反而一些舊的方法只能在具有實驗室背景的情況下才能進行，并且老的方法不能在14天，甚至1周內得出結果，而新的方法可以。”