根據融合時細胞的完整程度，原生質體融合可分為兩大類：
?對稱融合（symmetric fusion）－即兩個完整的細胞原生質體融合。
?非對稱融合（asymmetric fusion）－利用物理或化學方法使某親本的核或細胞質失活后再進行融合，它可以分為幾種：
用于細胞核或細胞質失活的方法分為物理和化學兩大類：
?物理方法常采用射線處理，如X射線、射線等，它們能使細胞核失活；還有離心，振動，電激等。
?化學處理常用的試劑有聚乙二醇（PEG）誘導融合，核失活－碘乙酰胺（IOA）、碘乙酸(Iodoacetate)；質失活－羅丹明（一種能夠抑制線粒體的氧化磷酸化過程而達到失活作用的親脂染料）