肌肉組織
在肌肉組織中最初進行外源基因活體導入是采用電穿孔法。選擇肌肉組織作為靶組織是因為肌肉組織在體內所占比例很大,約占40 % ,而且外源基因可在肌肉中長期表達、分泌,在基因治療中經常會用到。此外,外源基因也不會因肌細胞的分裂而丟失。
皮膚
皮膚組織相對于其他組織較難進行電穿孔法的基因導入,因為皮膚比較薄,電阻相對低,要求電流較高。但如果電流過大,會嚴重影響基因的表達,因此應適當降低電流和電壓,延長電穿孔的時間。另外,由于皮膚組織含有的脂肪細胞分布不均,會干擾電穿孔的作用,因此只推薦用鑷狀電極,且應將動物被毛刮凈后操作。雖然外源基因在皮膚中表達的時間較肌肉中短,但可利用活體電穿孔法對很多皮膚疾病進行治療。
肝臟
由于肝臟的生理代謝十分旺盛,因此外源基因在肝臟中的表達時間往往很短暫,而且表達產物的水平也較低。為減少出血,可從小靜脈注入，然后在肝臟上施加電場,能顯著增強基因的表達。
睪丸
相對于其他的轉基因方法,活體電穿孔法可使外源基因在睪丸中產生大量和持久的表達。此外,很多研究人員希望利用活體電穿孔法將外源基因導入精子, 進而通過授精得到轉基因動物。Yamazaki 等［13 ］ 和Ryoki 等［14 ］ 用甲磺酸丁二醇二酯注射或用手術法將動物人為造成隱睪,大部分體細胞和分化了的精母細胞減少,這樣使外源基因導入精原細胞的幾率增加。Ryoki 等［14 ］ 將基因與病毒誘導的整合酶基因共轉染,可在精原細胞中檢測到外源基因的表達,且病毒誘導的雙基因共轉染較單基因整合效率更高。但目前用這種方法獲得轉基因動物還較難。
禽類輸卵管
對禽類輸卵管活體電穿孔的研究很少,但這一方法卻有很廣闊的發展前景。因為輸卵管腺體細胞具有很強的分泌功能,可以將大量蛋白分泌到雞蛋中。也可以利用此瞬時表達系統檢測含卵清蛋白啟動子的載體功能。Park 等用活體電穿孔法以熒光素基因導入雞輸卵管上皮,檢測到熒光素活性約4500RLUPmg 組織［15 ］ 。
眼睛、胚胎和禽類胚盤
這三種組織都是很脆弱的,如果實施基因槍法,會使靶組織因強烈的機械損傷而失去功能或直接導致發育停滯。Sakamoto 將血纖蛋白溶酶原激活因子基因導入眼睛中,有效抑制了眼睛在淤傷后血纖蛋白的反應。哺乳動物胚胎的電穿孔操作包括離體和子宮內操作。禽類胚胎基本是在蛋殼中進行電穿孔的,而且表達快速,Momose 等報道電穿孔施加后215 小時在雞胚中就可以檢測到外源基因的表達,這在使用病毒載體時也是不可能的。當電場被限定在一個很小的范圍內時,基因可以定點表達, 這是活體電穿孔法的又一優點,Katahira 等［17 ］ 證實可將外源基因導入雞胚大腦、心臟和一些微小組織(如中胚層,間充質和體節) 中進行表達。