治療原則是通過改善運動功能以改善生活質量，主要治療方法是依據該病的指南采取藥物和手術治療。
膽堿酯酶抑制劑，是治療該病的首選藥物。
對于伴隨出現重癥肌無力危象的患者首先需要保持呼吸道通暢，而后盡快進行血漿置換，也可以單獨或加用靜脈滴注丙種球蛋白。
全身型重癥肌無力優先考慮手術切除胸腺，有胸腺瘤者必須手術治療。若胸腺瘤有惡性傾向，術后還需放療。
術后還存在癥狀的患者需使用糖皮質激素及其他免疫抑制劑。對上述治療效果不佳者可以使用B淋巴細胞清除劑。
