總的來說，HSP的誘導和調節的機制迄今還不清楚，只有一些推測。
應激原誘導HSP生成的速度很快。將果蠅從25℃移至37℃環境，只要20分鐘，就可以檢出HSP，因而有人推想高溫是通過某種已經存在的調節因子作用于基因并從而使轉錄加強的。實驗證明，用熱休克細胞的胞漿提取物可以誘導果蠅幼蟲唾液腺細胞核內染色體的蓬松現象，而未經熱休克的對照細胞胞漿無此種誘導作用。提示胞漿內存在的某種物質，在應激時可被活化而轉位到核內，進而啟動基因對HSp mRNA的轉錄。
上述的染色體蓬松現象，即使是在應激原的持續作用下，一般也都在60分鐘以內消失，而HSP則由于降解較慢，故可持續存在6小時，提示HSp mRNA的轉錄受HSP的負反饋調節。