根據GHRH-GH-IGF（下丘腦-生長激素-胰島素樣生長因子）軸功能缺陷，病因可分為原發性或繼發性GHD，單純性GHD或多種垂體激素缺乏。主要病因如下：
1.原發性
（1）遺傳包括激素異常或者受體異常，也包括與垂體發育有關的基因缺陷。
（2）特發性下丘腦功能異常，神經遞質-神經激素信號傳導途徑的缺陷。
（3）發育異常垂體不發育、發育不良，空蝶鞍，視中隔發育異常等。
2.繼發性
（1）腫瘤下丘腦、垂體或顱內其他腫瘤，例如顱咽管瘤、神經纖維瘤、錯構瘤等。
（2）放射性損傷下丘腦、垂體腫瘤放療后。
（3）頭部創傷產傷、手術損傷、顱底骨折等。