糞便標本應取蠶豆大小的一塊送檢，并注意選取有膿血或其他異常外觀的部分送檢。取標本時應注意糞便的顏色與外觀，并應向醫生敘述，住院病人必要時應留給醫生觀看糞便的形狀、外觀和顏色，因為這些內容對某些疾病的鑒別和診斷有一定價值。做糞便潛血試驗要求三天內不食用瘦肉類、含動物血類、含鐵劑的藥物等，避免出現干擾；如果醫院使用單克隆抗體法潛血實驗則可不需要注意這些問題。所留取的標本應放在潔凈的不吸水的蠟盒或塑料盒內送檢，千萬不要用紙張包裹，因為粘液和細胞等成分會被紙張吸收和破壞，不能得到準確的結果。如是用于做糞便細菌培養用的標本，一定應使用醫院實驗室提供的消毒專用標本盒，以避免其他細菌混入你的標本中。