病毒分類的依據和原則是病毒的基本性質。
病毒分類的一般系統是科、屬、種3級。將病毒分為DNA病毒、RNA病毒、DNA和RNA逆轉錄病毒三大類。目前認為有24個科的病毒能感染人和動物。
按感染部位與癥狀特征：肝炎病毒、出血性熱病毒、皰疹病毒等。
按傳播途徑：呼吸道病毒、胃腸炎病毒、經性傳播感染的病毒等。
