在染色體上,著絲粒有多種可能的存在位置。一般來講,主要的位置有中間著絲,亞中間著絲,近端著絲,端著絲。
中間著絲
著絲粒位于染色體的中心,染色體兩臂幾乎等長,形成"X"形狀。在人類染色體組中,第1,3,16,19,20號染色體是中間著絲的。有些情況下,中間著絲通過兩個近端著絲染色體的融合形成。
亞中間著絲
如果與中間著絲類似,而染色體兩臂不等長,則為亞中間著絲。
近端著絲
如果染色體短臂存在,但由于過短而難以觀察,則成為近端著絲。人類染色體組中13,14,15,21,22號為近端著絲。在這種著絲情況下,染色體短臂(p)內仍然包含遺傳物質,如核仁組織區域。
端著絲
端著絲情況下著絲粒位于染色體的末端。兩條染色體的端粒從末端延伸并結合。此時染色體只有一條臂。典型例子在家鼠的染色體組中出現。
除這幾種常見著絲方式以外,也存在其他組織方式。如全著絲,整條染色體都作為著絲粒區域,最知名的例子是秀麗隱桿線蟲(Caenorhabditis elegans)。無中心,此時染色體缺少著絲粒。