離子交換層析(ion-exchange chromatography,IEC) 是在生物大分子提純中得到最廣泛應用的方法之一。
離子交換層析分離蛋白質是根據在一定pH 條件下，蛋白質所帶電荷不同而進行的分離方法。常用于蛋白質分離的離子交換劑有弱酸型的羧甲基纖維素(CM纖維素) 和弱堿型的二乙基氨基乙基纖維素(DEAE纖維素)。前者為陽離子交換劑，后者為陰離子交換劑。
