1、慢性腹瀉：腹瀉程度輕重不一，輕者每日排便3～4次，或腹瀉便秘交替出現；重者可每1～2小時一次。部分患者可有夜間腹瀉和（或）餐后腹瀉。直腸嚴重受累時，可出現里急后重感。糞質多呈糊狀，混有大量黏液，甚至帶膿血。
2、反復腹痛：腹痛多為慢性，時輕時重，有時腹痛先于腹瀉，有時伴有發熱、惡心、腹脹、食欲減退等癥狀，腹痛可為臍周或左下腹。
3、其他表現：偶爾表現為關節炎，虹膜睫狀體炎，肝功能障礙和皮膚病變。由于長期發作，患者往往表現為體重減輕和面色蒼白，在疾病活動期腹部檢查時結腸部位常有觸痛。可能有急腹癥征象伴發熱和腸鳴音減少的現象，在急性發作或暴發型病例中尤為明顯。