90％以上的類癌瘤發生于胃腸道，主要見于闌尾、末端回腸和直腸，少數發生于結腸、胃、十二指腸、Mckel憩室以及膽道、胰管、性腺、肺和支氣管等。不同種族的人群，類癌的好發部位可能有差別。在日本的病例中發生于胃、十二指腸和結腸的類癌較歐美病例為多，小腸類癌則較少，推測此可能與日本人和歐美人各臟器中嗜鉻細胞分布不同有關。 Godwin綜合2837例類癌，85.5％分布于胃腸道內。胃腸道外的發病部位有支氣管、肺頭、肝、胰、子宮頸、腮腺、尿道、甚至睪丸或卵巢等。Orloff綜合文獻3000例胃腸道類癌的分布，依次為闌尾47.0％、回腸27.5％、直腸17.0％、胃2.5％、結腸2.0％、空腸1.5％、十二指腸1.3％、Meckel憩室1.0％、膽囊0.2％。以闌尾最多見，闌尾、回腸和直腸三者占全部胃腸道類癌的90％以上。
典型的胃腸道類癌，瘤常為細小的黃色或灰色粘膜下結節樣腫塊，單發或多發，粘膜表面多完整，其形態不一，有結節狀，息肉樣或環狀等表現。少數瘤體表面可形成潰瘍，外觀酷似腺癌，常侵入肌層和漿膜層。一部分病人可有多源性類癌瘤存在。回腸類癌常為多發，瘤體較小，直徑為3.5cm以下，多在1.5cm左右。國內一組統計78例，直腸類癌部位均在直腸10cm以下范圍，瘤體大小約0.2～2.5cm，多小于1.0cm，形似息肉，但無蒂。切面觀呈灰白或灰黃色，質硬，邊界清楚。
類癌細胞在顯微鏡下呈方形，柱狀，多邊形或圓形。細胞核均勻一致，很少有核分裂相，細胞漿內含有嗜酸性顆粒。根據電子顯微鏡的觀察，胃腸道各部分類
癌的胞漿內顆粒形態與組織化學各呈不同表現。小腸類癌細胞內含有較大而多形的顆粒，銀染色反應陽性故為親銀性。胃類癌細胞的顆粒呈圓形，銀染色反應時，必須加入外源性還原劑才呈陽性反應，故為嗜銀性。直腸類癌細胞的顆粒較大，圓形，均勻一致，親銀和嗜銀的染色反應均陰性，故為無反應性。
類癌的組織學結構特點為瘤細胞的排列呈多樣化，Soga等根據排列方式分成5型。
A型
類癌細胞聚成結節性之實性巢團，細胞大致圓形，排列不規則，呈索狀侵入周圍。多見于起源中腸系統的類癌，是最典型的一型。
B型
瘤細胞呈狀結構，排列成一層，如殼狀，細胞核在周邊部分，排列整齊如柵狀或條帶狀，多見于起源于前腸系統的類癌。
C型
方型細胞排列成腺體狀，但其中無空腔，或成玫瑰花型。
D型
瘤細胞形狀不規則，排列不規則，成大片髓樣結構。C型及D型多見于起源于后腸系統的類癌。
E型
為上述四型的各種混合型。
類癌的不典型增生和核分裂相均不明顯，一般很難從細胞形態來判斷其惡性程度。可以參考：①類癌的大小，綜合843例手術資料，最大直徑在1cm以下者，90％～100％表現為良性病程。1～2cm之間者，30％～50％有轉移。直徑＞2cm者，80％～100％有轉移。②浸潤程度，據統計已侵犯胃腸道肌層的類癌，90％發生轉移。③生長部位，闌尾類癌幾乎都呈良性病程，即使已浸潤至漿膜，發生轉移仍較少見（＜2％）。
小腸類癌的轉移率為30％，結腸為38％。十二指腸和胃的惡性類癌比小腸少見。
類癌的轉移途徑可以直接浸潤生長，穿透漿膜至周圍組織內，亦可發生淋巴轉移或血行轉移。并無局部淋巴結轉移而直接發生血行轉移亦偶見有報道。血行轉移以肝最多見，亦可轉移至骨、肺及腦，其他少見之轉移部位見諸報道的有：卵巢、附睪、皮膚、骨髓、后腹膜、眼眶、腎上腺、脾、胰、腎、甲狀腺、膀胱、前列腺、子宮頸。亦有轉移入乳腺的報道，其臨床體征與原發乳腺癌極為相似。
類癌細胞起源于APUD細胞系統中的腸嗜鉻細胞（又名kulchitsky細胞），此種細胞來源于胚胎神經嵴，廣泛分布于消化道，具有嗜鉻親銀的顆粒，能產生多種肽胺類激素。近年來隨著免疫組織化學技術的進展，已使多種激素在組織切片上得到證實。類癌綜合征系由于血清素和多種血管活性物質經肝臟形成代謝產物，經血進入肺和心臟，使肺動脈和心內膜下纖維組織增生，約半數病例伴有右心瓣膜病變，包括肺動脈瓣及三尖瓣增厚、縮短、僵硬、粘連。心內膜和腱索可發生纖維增厚，引起肺動脈瓣狹窄，三尖瓣閉鎖不全等。左心內膜下彈性纖維內層有局灶性或彌漫性纖維增生等心臟病變，尤以支氣管類癌發生左心、肺動脈、三尖瓣、主動脈瓣纖維化更為多見。