細胞轉瓶機有多種分類方式和類型，一般可以按照培養方式，轉速，轉瓶體積，瓶位數進行分類。用戶需要根據自己的需求進行合理的選擇。
（1）培養方式
按照培養方式進行分類，細胞轉瓶機可以分為懸浮培養，貼壁培養，貼壁/懸浮培養二合一。
（2）轉瓶轉速
不同類型的細胞轉瓶機的轉速不同。通常情況下，貼壁培養的細胞轉瓶機，進口的轉速有3-60轉/小時，國產的一般是3-20轉/小時。懸浮培養的細胞轉瓶機進口的轉速是60-900轉/小時，貼壁/懸浮培養二合一的轉速一般1-999轉/小時。
（3）轉瓶體積
轉瓶體積有幾種不同類型：1500ml,2000ml,3000ml,10000ml,15000ml。
（4）瓶位數
一般細胞轉瓶機分為幾層，總瓶位數是用戶在選擇轉瓶機時的一個重要參數：通常1500ml的轉瓶體積對應的瓶位數有2,3,4,6,8；2000ml的轉瓶體積對應的瓶位數有4,8；3000ml的轉瓶體積對應的瓶位數有4-80不等；10000ml的轉瓶體積對應的瓶位數有20,25；15000ml的轉瓶體積對應的瓶位數有20-30不等。