利用微生物對不同碳源代謝率的差異，針對每一類微生物篩選95種不同碳源，配合四唑類顯色物質（如TTC、TV），固定于96孔板上（A1孔為陰性對照），接種菌懸液后培養一定時間，通過檢測微生物細胞利用不同碳源進行新陳代謝過程中產生的氧化還原酶與顯色物質發生反應而導致的顏色變化（吸光度）以及由于微生物生長造成的濁度差異（濁度），與標準菌株數據庫進行比對，即可得出最終鑒定結果。
·鑒定細菌時，全部基于顯色反應原理
·鑒定酵母時，A-C行基于顯色反應原理，D-H行基于濁度差異原理
·鑒定真菌時，系統自動為95種碳源測定兩套數據，即顯色反應和濁度