（一）病因治療 積極治療原發性疾病和去除引起免疫缺陷的理化因子是治療繼發性免疫缺陷病的關鍵；當二者必舍其一時，則以治療原發病為主。
（二）免疫增強和免疫替代 除注意營養和休息外，當體液免疫缺陷時，每月按0．1～0．2g/kg劑量輸注一次丙種球蛋白，可提高血清抗體水平；如患者伴有營養不良，補體不足時，給予新鮮或凍藏血漿療法較為適宜。近年來，國內已有從人乳中提取的含分泌型IgA的制劑，口服后可提高胃腸道局部免疫水平。于T細胞、吞噬細胞功能缺陷時，服用左旋咪唑，注射轉移因子、胸腺肽有可能改善這些細胞免疫功能。有些中草藥如人參、黃芪、茯苓等已被證實具有提高細胞免疫應答和增強吞噬細胞功能的效用。
（三）控制感染 是切斷感染與免疫不足惡性循環的另一重要環節；與上述提高免疫力措施相輔相成，才能取得較好療效。