測量分子量。
肽圖分析。
蛋白質大小的估計。
確定蛋白質亞基或聚集結構。
蛋白質純度的估計。
蛋白質定量。
監測蛋白質完整性。
比較不同樣品的多肽組成。
多肽亞基的數量和大小的分析。
電泳后應用，例如蛋白質印跡。
不含有機溶劑和乙酸的考馬斯G-250凝膠中的蛋白質染色。
通過重復使用商業磁帶來澆鑄和運行蛋白質凝膠。
使用CyDye DIGE Fluor最小染料對細胞表面蛋白進行選擇性標記。
蛋白質泛素化的檢測。
