檢測肺炎衣原體最常用的血清學方法是微量免疫熒光抗體檢測法（MIF），被公認為肺炎衣原體感染血清學診斷的金標準。人類感染肺炎衣原體后會出現抗肺炎衣原體血清抗體，初次感染時,大約在發病3周后出現IgM抗體，6-8周出現IgG抗體，再次感染或重復感染后，常在1-2周內出現較高水平的IgG抗體。MIF方法的原理是用肺炎衣原體標準株（TW-183或AR-39）制備抗原片，然后與病人血清反應，病人如為肺炎衣原體感染，其血清中抗肺炎衣原體IgM或IgG就會與抗原片上的肺炎衣原體結合，加入抗人IgM或IgG熒光標記抗體后，在熒光顯微鏡下可觀察到肺炎衣原體顆粒。MIF的診斷標準為：①急性感染：雙份血清抗體效價升高4倍以上，或IgM≥1∶16，或IgG≥1∶512；②既往感染：1∶16≤IgG<1∶512；③未感染過：IgG<1∶16；④慢性感染：iga>1∶8。