脂蛋白腎小球病的發病機制尚未完全闡明,多數認為與脂質代謝異常有關。現已知道,脂代謝異常會促發腎小球損傷;而腎小球病變也會影響到脂質代謝。許多全身性疾病(包括罕見的Fabry病、NiemanPick及Gaucher病)會使腎內脂質沉積增加,相當常見的是腎內脂質沉著是繼發于腎病綜合征,高脂血癥是其特征性的表現,因為腎病綜合征經過有效的治療而使血漿脂質正常化,這種情況下高脂血癥是腎臟疾病的后果。