先天性病變如尿道狹窄、后尿道瓣膜、膀胱頸攣縮，梗阻促進憩室的形成與發展，為憩室產生的主要因素。臨床上大多數膀胱頸梗阻的病人不發生憩室，而一些憩室病例中沒有梗阻存在，因此膀胱憩室的形成亦與膀胱肌纖維先天性排列異常有關。下尿路梗阻和高壓為繼發性膀胱憩室形成的主要原因。
臨床上憩室以位于輸尿管口附近者最常見。胚胎發生上，膀胱壁與膀胱三角區不同，目前認為三角區與逼尿肌連接薄弱與膀胱憩室的形成有關。
輸尿管開口盲端亦可發生膀胱憩室，Oriasa(1990)報道2例輸尿管開口盲端導致輸尿管及膀胱憩室。
另一型膀胱憩室位于頸部，可能與臍尿管消失不全有關，常繼發于下尿路梗阻或梨狀腹綜合征(Prune-belly綜合征)。