融合基因可在原核細胞(如大腸桿菌) 也可在真核細胞中進行表達。
原核表達系統的特點是時程短，費用低，是科研中的主要工具。其缺點是真核蛋白表達沒有得到確切修飾；大量蛋 白常常沉淀成不溶性包涵體聚合物，需要復雜的變性和復性過程；大量蛋白的分泌較困難。真核表達系統的特點是蛋白翻譯后加工機會多，甚至可被改造成人源型；真核細胞易被轉染，具有遺傳穩定性和可重復性；產物可被分泌，提純簡單，成本低。
