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  • 發布時間:2019-04-12 15:59 原文鏈接: 超詳細的實驗圖像自動化分析方法

    德國易必迪 ibidi 公司專注于細胞培養及功能實驗的耗材及儀器開發,目前已研制出一系列廣受好評的細胞功能實驗的相關產品,例如研究細胞遷移的 culture-insert 產品、研究細胞侵襲的 ibipore、研究血管生成以及細胞趨化系列產品等。

    我們知道在這些功能研究中,除了做好實驗部分,數據分析也是很非常重要的一個環節。圖像處理往往會消耗工作人員大量精力,而且容易帶入人為主觀性,導致所得結果的準確性和可重復性稍差。

    ibidi 公司與 Wimasis 合作開發了一系列相關的自動化分析軟件,可以幫助科研工作者從圖片中獲得更多的定量數據,并節約大量時間。

    WimScratch——傷口愈合圖像分析

    WimScratch 傷口愈合圖像分析軟件能在幾分鐘內對 2D 的細胞遷移和傷口愈合實驗做成像分析和數據處理。無需任何額外的軟件和硬件,只需將圖片上傳到數據分析平臺。通常情況下,幾個小時之內即可獲得分析結果。

    利用 ibidi culture insert 產品做傷口愈合實驗,從樣品制備到獲得統計結果,只需要四步:鋪細胞,產生劃痕——獲得顯微鏡成像結果——上傳圖片、圖像處理——獲得統計結果。

    與手動劃痕及手動軟件分析方法相比較,culture insert 產品可以產生邊緣整齊的 500μm 的無細胞間隙,無需進行劃痕區域寬度的校正;WimScratch 分析軟件可以幫助您在短時間內獲得可靠的多種定量分析結果。

    分析數據包括:

    a) 細胞覆蓋面積

    b) 終止速度(平均≥5 個圖像)

    c) 加速特征(平均≥5 個圖像)

    d) 概覽圖

    e) 中間接合處的近似值(平均≥5 個圖像)

    產品特點:

    1. 全面解決傷口愈合實驗-從樣品準備到成像分析只需要幾步2. 客觀的和可再生分析

    3. 簡單并且快速的數據處理-幾分鐘出結果

    4. 不需要額外的硬件或者軟件

    應用:

    1.傷口愈合和細胞遷移實驗結果定量化;

    2.細胞遷移實驗成像分析和數據處理。

    WimTube——血管生成圖像分析

    同 WimScratch 傷口愈合圖像分析軟件一樣,WimTube 血管生成圖像分析軟件是一款基于網站的自動化分析平臺。您無需任何額外的硬件及軟件,只要將您血管生成的圖像上傳,軟件自動分析。通常幾個小時內,幾個小時之內即可獲得分析結果。

    血管形成圖像分析是血管生成實驗中的一個關鍵步驟。通過 ImageJ 或者 Fiji 等軟件進行手動分析,通常耗費時間,而且容易帶入人為主觀因素,導致所得實驗結果的可靠性和可重復性不盡人意。

    WimTube 軟件可以自動化分析成環數量、分叉點數量等,并且在圖片上通過顏色 、點等特征進行標注,分析結果易于理解、可靠、可重復。

    數據分析結果包括:

    1. 小管長度,數量和平均值

    2. 細胞覆蓋面積

    3. 環狀結構的數量,區域和周長

    4. 分叉點的數量

    產品特點:

    1. 全面解決血管生成實驗-從樣品準備到成像分析僅需幾步;2. 客觀性和可重復性實驗分析;

    3. 簡單快速的數據處理-幾分鐘出結果;

    4. 不需要額外的硬件和軟件。

    應用:

    1. 定量化分析血管生成實驗;

    2. 血管生成實驗成像分析和數據處理;

    3. 研究血管生成抑制。

    WimSprout——出芽實驗圖像分析

    出芽實驗是血管新生研究中另一種非常常用的研究手段。WimSprout 圖像分析軟件應用于血管生成研究及腫瘤生長的出芽實驗圖像分析。同樣,您只需要上傳實驗圖像,幾個小時后,通過郵件,您即可獲得出芽實驗的分析結果。

    產品特點:

    1. 全面解決血管生成實驗中的出芽研究-從樣品準備到成像分析僅需幾步;

    2. 客觀性和可重復性實驗分析;

    3. 簡單快速的數據處理-幾分鐘出結果;

    4. 不需要額外的硬件和軟件;

    5. 可應用于:出芽球體實驗、動脈環實驗、纖連蛋白凝膠珠實驗。

    應用:

    1. 定量化分析出芽實驗;

    2. 動脈環實驗成像分析和數據處理;

    3. 研究出芽增強或者抑制;

    4. 纖連蛋白凝膠珠實驗。

    WimTaxis——細胞趨化圖像分析

    同樣是一款基于網頁的定量成像分析軟件,可在相差顯微鏡中自動跟蹤非標記細胞趨化性試驗。您只需上傳數據到圖像分析平臺,幾個小時之內即可獲得分析結果。

    WimTaxis 在趨化實驗中可以準確檢測視頻中的細胞和細菌。通過追蹤細胞及細菌的運動進而提供他們的運動軌跡。根據您的分析對象,選擇 WimTaxis-Cell 或者 WimTaxis-bacteria 模式,就可以快速、可靠的獲得您的分析結果。

    數據分析結果包括:

    1. 細胞追蹤定位動畫顯示;

    2. 遷移效率(水平和垂直方向);

    3. 細胞追蹤軌跡視頻;

    4. 蹤跡和質心統計。

    產品特點:

    1. 全面解決細胞趨化性實驗-從樣品準備到成像分析僅需幾步;2. 客觀性和可重復性實驗分析;

    3. 簡單快速的數據處理-幾分鐘出結果;

    4. 不需要額外的硬件和軟件;

    5. 兩種模式可選:細胞追蹤和細菌追蹤。

    應用:

    1.2D 細胞趨化性實驗定量分析;

    2. 細菌趨化性實驗定量分析;

    3. 細胞趨化性和遷移實驗成像分析和數據處理。


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