鑒別培養基:利用細菌分解糖類和蛋白質的能力及其代謝產物的不同,在培養基中加入特定的作用底物和指示劑,觀察細菌生長過程中分解底物所釋放的不同產物,通過指示劑的反應不同來鑒別細菌。例如糖發酵管、克氏雙糖鐵瓊脂(KIA)、伊紅-亞甲藍瓊脂和動力-吲哚-尿素(MIU)培養基等。
選擇培養基:在培養基中加入抑制劑,去抑制標本中的雜菌生長,有助于所選擇的細菌種類的生長。例如培養腸道致病菌的SS瓊脂,其中的膽鹽能抑制革蘭陽性菌,枸櫞酸鈉和煌綠能抑制大腸埃希菌,因而使致病的沙門菌、志賀菌容易分離到。