酶標儀主要是用來讀取酶聯免疫試劑盒的反應結果，因此要得到準確結果，試劑盒的使用必須規范。許多醫院在使用酶標儀之前是通過目測判斷結果，操作過程隨意性較大，在使用酶標儀后如果不能及時糾正操作習慣，會造成較大誤差。
操作中應注意幾點：
在測量過程中，請勿碰酶標板，以免酶標板傳送時擠傷操作人員的手
請勿將樣品或試劑灑到儀器表面或內部，操作完成后請洗手。
儀器如果接觸過污染性或傳染性物品，請進行清洗和消毒
洗板要洗干凈。盡量使用洗板機洗板，避免交叉污染。
嚴格按照試劑盒的說明書操作，反應時間準確。
使用加液器進行加液，加液頭不能混用。
不要在測量過程中關閉電源。
使用后蓋好防塵罩。
對于因試劑盒問題造成的測量結果的偏差，可以根據實際情況及時修改參數，以達到zui佳效果。
使用的樣品或試劑具有污染性、毒性和生物學危害，請嚴格按照試劑盒的操作說明，以防對操作人員造成損害。
出現技術故障時應及時與廠家，切勿擅自拆卸酶標儀。