在術前根尖周病變的診斷中，二維X線片可能會誤報病變的實際大小及相關的骨質破壞；可能無法顯示根尖周病變的骨松質破壞，當X線片上顯示出透射影像時，已經到達骨密質被破壞的程度。CBCT能對頜骨進行全方位掃描及三維觀察，廣泛應用于口腔醫學。
與傳統的X線片對比，CBCT采用橫斷面和冠狀位等多個角度構建三維圖像，能夠清晰直觀地反映出根尖周病變的位置、范圍、程度及性質，有利于了解患者的牙體內部形態和根尖周牙槽骨量，大大提高了根尖周病變的檢出率。在對根尖周炎的診斷中，CBCT顯像的準確率為96%，傳統根尖周片為73%，數字根尖周片為72%。
本病例根據病史、臨床檢查及傳統的根尖片，結合CBCT輔助檢查，12、13初步診斷為根尖囊腫。由于囊腫直徑＞1 cm，病變范圍較大，波及上頜前牙區2顆牙，擬對患牙實行一次性根管治療后行顯微根尖手術，徹底刮除囊腫，并切除根尖、MTA倒充填。術后建立定期回訪以判斷療效。組織病理學分析仍然是鑒別根性囊腫和肉芽腫的標準方法。
目前尚無普遍接受的方法可用于術前鑒別二者，因此，所有根尖周炎性病變首先使用非手術方法治療，明確效果后再考慮是否外科手術治療。囊腫內的上皮組織是導致囊腫形成和復發的關鍵因素，因此根治囊腫必須消除上皮組織。目前普遍認為袋形囊腫能在根管治療后愈合，而真性囊腫，因上皮完全封閉，與根管管腔并不連通，根管治療效果不佳。根尖手術被認為是一種預后良好，用以挽救根尖病變、傳統非手術治療無法治愈的患牙。
根尖手術治療可進一步分為根尖刮除、根尖端切除、根尖截肢或半切斷術。根尖切除術是其中的首選，可用以消除未經治療的根尖分歧。對于根尖病變面積較大的患牙，若患者全身及患牙情況均允許，將根管治療聯合根尖手術治療，能夠提高成功率和縮短療程。
近年來，口腔手術顯微鏡及超聲器械在根尖手術治療中的廣泛應用，手術視野更為清晰，可操作性增加，大幅提高了根尖手術的成功率。對于持續的牙髓病變，定期檢查是十分重要的，而建立定期回訪有利于根尖手術后觀察手術療效和準確判斷預后情況。
臨床上術后患牙能夠保留在口腔內，病損尺寸有確切縮小，且無癥狀，認為病例是成功的。根據臨床及影像學檢查評價療效：有效——無任何臨床癥狀及體征，X線片顯示完全愈合或不完全愈合；無效——有臨床癥狀和（或）體征，X線片顯示未愈合。X線根尖片與臨床檢查相結合，長期以來一直是術后愈合評估的標準。
CBCT輔助檢查能清晰反映根尖周組織情況，其不僅適用于根尖囊腫術前診斷，也是術后評估療效首選的影像學檢查方法。本病例顯微根尖手術后1個月、6個月和30個月復查，臨床檢查患牙已無癥狀，X線片可見透射區的范圍逐漸縮小。術后10個月與30個月CBCT復查，根尖囊腫處骨腔縮小，骨缺損區的骨密度逐漸增加，唇側骨皮質仍有少許凹坑狀缺損。目前認為，術后6個月、12個月、24個月都應復查臨床表現和X線片。在根尖囊腫范圍較大，波及多顆牙時，應用CBCT輔助檢查在術前和術后均可減少患者受檢次數。