初做柱層析很容易把柱子裝得長了或短了，有時還會有大量的硅膠剩余，浪費硅膠，這主要是對硅膠等固定相的使用的量沒有掌握。柱層析用的硅膠一般是 100-200 目，100 毫升硅膠的質量在47 克左右，如果裝一個直徑是 2.8 厘米的柱子，可以裝 18 厘高。
為了避免浪費硅膠和溶劑，最初學習裝柱時最好對實驗室中各種不同規格的柱子摸摸底。方法很簡單：用量筒量出 100 毫升干硅膠， 直接倒入各種規格的柱子中，敲實，用刻度尺量出硅膠在柱子中的高度，這樣就可以做到心中有數了。
一般在裝柱的時候可以根據實驗所需柱子的高度來調整硅膠的使用量，這樣就可以大大地節省硅膠的使用，避免造成沒有必要的浪費。稱量硅膠時一般稱30~70倍于上樣量， 如果極難分， 也可以用100 倍量以上的硅膠。