lncRNA在農業領域的研究成果（二）

【思路及相應結果】

內容與圖片源：（王立方，2015）

【結論】

通過全轉錄組測序、lncRNA測序和實時熒光定量的方法發現和鑒定了與家蠶產絲相關的lncRNA和其在不同產絲階段的表達量變化，挑出了與家蠶產絲調控緊密相關的非編碼RNA和lncRNA。例如位于P25基因下游互補鏈的lncR2034，與P25基因在后部絲腺呈相反的表達關系，表明lncR2034可能在5齡后部絲腺具有負向調控P25基因表達的作用（上圖紅括號標出）。

二、牛脂肪細胞分化

【目的】脂肪或肌肉組織中的脂肪和脂肪酸成分，對牛肉的外觀、質地、風味、硬度和保質期等都有積極影響，是肉類營養價值的核心，闡明脂肪生成的調控機制對于提高肉品質具有重要意義。本研究為秦川牛優異肉質性狀遺傳機制、改善其生長速度，培育我國專門化的肉牛品種、提高畜牧業競爭力等方面奠定了基礎。

【方法】研究中運用了RNA高通量測序技術、cDNA末端快速擴增、RNA熒光原位雜交、基因過表達、RNA干擾、雙熒光素酶報告系統、基因定點突變等技術探索了一個lncRNA；ADNCR調控牛脂肪細胞分化的機制。

【思路及相應結果】

【結論】

①lncRNA高通量測序和lncRNA整體表達譜分析顯示了在秦川牛的脂肪細胞分化過程中有2,882個相關的lncRNAs表達，通過對于此結果分析，鑒定了新的lncRNAs，其中包括與代謝過程密切相關的ADNCR，同時清晰地顯示了基因在不同分化時期表達量的差異；

②差異表達分析和實時定光定量PCR(qRT-PCR)結果顯示ADNCR在脂肪細胞分化前后下調程度最大，生物信息學預測和體外翻譯試驗均表明ADNCR符合長鏈非編碼RNA的特征；

③ADNCR可能是潛在的ceRNA（內源性競爭RNA），通過與miR-204競爭結合SIRT1基因，提高表達量，抑制脂肪細胞分化；

④從5個本國品種的SIRT1基因中新鑒定到了5個SNPs位點；與南陽牛的生長性狀關聯分析表明，這5個SNPs與部分體尺性狀顯著相關；就基因分型方面，在秦川牛背最長肌、半腱肌和肝臟等組織中，AA基因分型會致使SIRT1基因的表達量減少。

參考文獻：（李朋勛，2016）

【總結】

在本研究中，研究者運用多種分子基因技術，在牛脂肪細胞模型中實現了非編碼RNA交互調控運用的分析與預測，落實ceRNA理論。同時對于牛的脂肪細胞分化進行了非常詳盡的研究，上述研究結果只是一部分而已。這說明著農業上的研究可以深入地聯合使用多種成熟的技術，從而得出高質量的研究成果。以上RNA測序，轉錄組測序，熒光定量分析，生物信息學分析預測，SNP檢測都是閱微基因能夠提供的業務。

三、白菜花粉受精

【目的】花粉形成和授粉受精是種子植物完成有性生殖及世代交替的重要環節，與生產上雄性不育系的利用、種子產量的高低與質量的優劣等息息相關。揭示其分子機理對于開展雜交育種、提高種子產量和質量等均具有重要意義。本例探討lncRNA在調控花粉發育和授粉受精等生殖發育過程中起到的作用，目前還鮮有報道。

【思路及相應結果】

參考文獻：（張芳，2015）