高通量測序技術（High-throughput sequencing）又稱“下一代”測序技術（"Next-generation" sequencing technology）簡稱“Ngs”，以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。
高通量測序技術是將DNA（或者cDNA）隨機片段化、加接頭，制備測序文庫，通過對文庫中數以萬計的克隆(Colony)進行延伸反應，檢測對應的信號，最終獲取序列信息。
