基因組所合作研究揭開兩種家養水稻起源進化“篇章”
6月9日，在最新一期的PLOS Genetics上，來自中國科學院北京基因組研究所的吳仲義研究員和中山大學施蘇華教授發表了合作研究文章《水稻基因組兩種進化歷史：馴化基因的角色》(Two Evolutionary Histories in the Genome of Rice: the Roles of Domestication Genes)，揭開了兩種家養稻起源進化的重要篇章。 水稻是最重要的糧食作物之一，供養著超過三分之一的世界人口。在我國及周邊很多亞洲國家，水稻是關乎國家民生大計的重要命脈。而目前，家養稻共分為粳稻和秈稻兩種品系。粳稻主要生長分布于中國北部、日本、韓國等高緯度地區。而秈稻主要生長分布在中國南部、東南亞、印度等低緯度地區。水稻是人類從打獵采集的生活狀態轉到農業栽種的過程中，被人類馴化培育的重要植物物種。兩種家養水稻的起源和演化，一直是進化生物學家、歷史學家和考古學家所關心的熱點問題。 ......閱讀全文
基因組所合作研究揭開兩種家養水稻起源進化“篇章”
6月9日，在最新一期的PLOS Genetics上，來自中國科學院北京基因組研究所的吳仲義研究員和中山大學施蘇華教授發表了合作研究文章《水稻基因組兩種進化歷史：馴化基因的角色》(Two Evolutionary Histories in the Genome of Rice: the R
腸道的進化起源
消化系統、皮膚、肌肉組織是如何進化的呢？這個問題困擾了科學家一個多世紀。維也納大學的研究人員對海葵（一種非常古老的動物）胚胎發育的研究結果質疑了150年前提出的形成所有器官和組織的胚層具有同源性的假說。 該假說認為，身體中所有的器官和組織都來源于三個胚層之一，這些胚層在胚胎形成早期出現。這
分子進化的起源
在漫長的進化過程中生物的 DNA經歷了各種各樣的變化。包括基因突變、基因重組、染色體易位等。堿基置換突變常導致蛋白質中一個氨基酸的改變。例如正常血紅蛋白第 6位的谷氨酸改變為纈氨酸便成為鐮形細胞貧血癥的血紅蛋白 HbS，為賴氨酸替代則成為HbC，前者的堿基是從GAA（谷氨酸）→GUA（纈氨酸），后者
浙大教授Nature子刊：水稻基因組重測序及群體遺傳學研究
浙江大學農業與生物技術學院作物科學研究所，中國水稻研究所的研究人員發表了題為“Genomic variation associated with local adaptation of weedy rice during de-domestication” 的文章，以雜草稻群體為材料，通過基因組
全球水稻去馴化、趨同野化的證據找到了
近日，開放獲取期刊《基因組生物學》（Genome Biology）在線發表了全球首次雜草稻調查研究結果。浙江大學教授樊龍江領導的一個國際研究團隊，通過對全球稻區雜草稻（俗稱鬼稻）材料采集與分析發現，水稻在世界各稻區均存在野化或去馴化的現象，并描繪了野化水稻的基因組特征。該成果對水稻進化、資源利用
上海生科所Nature基因組研究新成果
近日來自中科院上海生命科學研究院、日本國立遺傳學研究所和中國農業科學院的研究人員通過繪制水稻基因組變異圖譜揭示栽培稻(cultivated rice)的起源，相關論文“A map of rice genome variation reveals the origin of cultivate
PNAS：miRNA揭示脊椎動物進化起源
美英科學家的一項最新研究表明，脊椎動物這種復雜生命形式的出現源于miRNA。調控基因表達的miRNA的不斷進化是早期脊椎動物出現的背后原因。相關論文近日在線發表于美國《國家科學院院刊》（PNAS）上。?論文高級作者、美國達特茅斯學院的Kevin Peterson表示，“新的研究不僅為認識人類自身的進
Y染色體的起源與進化
許多屬于變溫動物的脊椎動物是沒有性染色體的。它們的性別由外界環境因素而不是個體基因型決定。這種動物中的一部分（例如爬行動物）的性別可能取決于孵化時的溫度；其他則是雌雄同體的（亦即它們每個個體中同時能產生雄性和雌性的配子）。 某個遠古哺乳動物的祖先發生了等位基因的變異（即所謂的“性別基因座”）—
基因組所與昆明動物所在家犬起源進化研究中取得新進展
5月14日，中科院北京基因組研究所與中科院昆明動物研究所在家犬起源進化合作研究中取得重要進展，相關論文在最新一期《自然·通訊》在線發表。該研究成果從全基因組層面上闡述了狗的起源進化，并首次將其進化歷史和人類的近期演化聯系了起來。 在昆明動物所張亞平教授和基因組所吳仲義教授的帶領下，昆明動物
什么是基因組進化？
基因組不僅僅是生物體基因的總和，基因組還含有其它可以考慮特定基因及其產物的特征。復制在基因組的塑造過程中起了重要作用。復制的范圍包括短串聯重復序列的延伸、基因簇的復制、整個染色體甚至整個基因組的復制。這種復制可能是創造遺傳新性狀的基礎。
基因組的進化特征
基因組不僅僅是生物體基因的總和，基因組還含有其它可以考慮特定基因及其產物的特征。復制在基因組的塑造過程中起了重要作用。復制的范圍包括短串聯重復序列的延伸、基因簇的復制、整個染色體甚至整個基因組的復制。這種復制可能是創造遺傳新性狀的基礎。
作物基因組學研究進展（一）
作物基因組學研究進展農作物基因組學研究的發展，對于有效利用現代分子生物學手段進行物種的遺傳改良發揮了重要作用。隨著測序技術的發展，已經實現對重要農作物，如水稻、小麥、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因組的測序或重測序，在此基礎上完成對控制重要農藝性狀基因的克隆和鑒定。本文綜述了２０１8年度主要農
浙大科學家揭秘“鬼稻”身世
在科學界，“鬼稻”叫雜草稻，它們直接導致稻田減產，品質下降，并被定性為田間的惡性雜草。浙江大學農業與生物技術學院作物科學研究所樊龍江教授團隊聯合中國水稻研究所科研人員通過基因組重測序及其群體遺傳學分析，揭示了其中最基本的問題，鬼稻從何而來，它們“鬼”在何處。 相關成果論文《雜草稻通過基因組變異
綿羊基因組揭示中國游牧民族發展史
近日，中國科學院動物研究所李孟華研究組在《分子生物學與進化》雜志在線發表了一篇研究中國綿羊的起源、分化、擴張和混合，以及早期游牧民族發展史的文章。 綿羊作為最早的馴化動物之一，與人類生活，尤其是游牧民族的生活息息相關。通過解析綿羊的種群歷史，如遷徙、擴散、品種選育歷史，在一定程度上揭示了早期人
植物所證實水稻是多次起源的產物
亞洲稻又稱水稻（Oryza sativa?L.）。亞洲稻包括粳稻（Japonica）和秈稻（Indica）兩個亞種，不僅是最重要的糧食作物之一，也是理論研究中日益受到重視的模式生物。盡管迄今針對水稻開展了大量研究，但關于水稻起源/馴化的歷史已爭論了半個多世紀，存在各種推論和觀點。目前存在兩種主流假說
中科院Science公布最新基因組
繼2012年中國科學院昆明動物研究所、深圳華大基因研究院等單位合作完成了首個山羊全基因組圖譜之后，6月昆明動物研究所，華大基因等處的研究人員又公布了綿羊基因組序列，并且將這一基因組與其它哺乳動物基因組進行了比對，構建了相關的系統發育樹。這一研究成果公布在6月6日Science雜志上。 參與這項
病毒與細胞在起源與進化中的關系
（1）基本觀點目前存在 3 種主要觀點：（2）觀點的比較①由于病毒徹底的寄生性，第一種觀點缺乏支持；②由于尚不能發現病毒的化石，第二種觀點缺乏充足的證據；③第三種觀點得到了更多的實驗結果的支持，例如：a．在原核細胞中，環形 DNA 分子的附加體可以以質粒的形式在細胞中復制，也可以整合在細菌的染色體中
細胞焦亡進化起源研究獲新進展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508150.shtm近日，華東理工大學生物工程學院、生物反應器工程國家重點實驗室教授劉琴課題組在細胞焦亡進化起源方面取得重要進展，首次在模式動物水螅中解析了動物界中祖先細胞焦亡信號通路并揭示其保守的抗感染
麻風病病原體的起源與進化
麻風分枝桿菌(Mycobacterium leprae)長久以來一直被認為是麻風病唯一的病原體(神秘的地球配圖) (神秘的地球報道)據EurekAlert!：科研人員報告了第二種導致麻風病的生物體的基因組序列，并且揭示出了這些病原體的起源與進化史。麻風分枝桿菌(Mycobacterium le
昆明動物所一項成果被評為2012年度云南十大科技進展
2月26日，2012年云南十大科技進展評選結果揭曉。中科院昆明動物研究所王文研究員團隊主持完成的項目“年輕新基因起源和遺傳進化的機制研究”成果喜獲該榮譽。 該項目首次在全基因組水平系統揭示了新基因起源的一般模式和各種分子機制的貢獻；首次實證了基因可以從頭起源；開創性地系統研究
研究揭示結構變異和新基因在家犬馴化中的作用
近日，中國科學院昆明動物研究所遺傳資源與進化國家重點實驗室、動物進化與遺傳前沿交叉卓越創新中心張亞平團隊與中國農業科學院農業基因組研究所開展合作，第一次系統地構建了家犬在馴化中的結構變異（Structural Variations）圖譜、探討了新基因在馴化中的作用、并指出了大尺度基因組變異在馴化
基因組測序揭示家鴿起源史
2月1日，由美國猶他大學、深圳華大基因研究院等單位合作完成的鴿子基因組研究成果在《科學》雜志在線發表。該研究從分子層面揭示了家鴿的起源歷史，并發現了鴿子羽冠多樣性的遺傳基礎。 據悉，鴿子是目前為數不多的已完成測序的鳥類之一，其基因組與家雞、火雞、斑馬雀及虎皮鸚鵡的基因組一起，
基因組測序揭示家鴿起源史
2月1日，由美國猶他大學、深圳華大基因研究院等單位合作完成的鴿子基因組研究成果在《科學》雜志在線發表。該研究從分子層面揭示了家鴿的起源歷史，并發現了鴿子羽冠多樣性的遺傳基礎。 據悉，鴿子是目前為數不多的已完成測序的鳥類之一，其基因組與家雞、火雞、斑馬雀及虎皮鸚鵡的基因組一起，將為鳥類的群體
上海交大張大兵Cell子刊：新基因從何而來？
來自上海交通大學、馬克斯普朗克分子植物生理學研究所以及萊斯特大學的研究人員報告稱，他們在擬南芥和水稻中追溯了一些蛋白質編碼基因的起源，基于研究發現他們提出了一個進化模型來解釋一些新基因從雄性生殖細胞中出現的機制。這項研究發表在6月1日Cell出版社旗下的《分子植物》（Molecular Plan
浙大樊龍江團隊如何從基因組學角度證實作物擬態的存在
稗草（Echinochloa crus-galli）是田間頭號雜草，為了除掉它，人類已經努力了幾千年。浙江大學農業生物與技術學院樊龍江教授團隊與中國水稻所等單位合作研究最新發現，為了避免人類的“驅逐”，田間的稗草們竟學會了“偽裝”。幾千年來，它們與水稻越長越像，從原來松垮貼地的懶樣子，進化出了今
雙“稻”傍地走，安能便我是“雄雌”
稗草（Echinochloa crus-galli ）是田間頭號雜草，為了除掉它，人類已經努力了幾千年。浙江大學農業生物與技術學院樊龍江教授團隊與中國水稻所等單位合作研究最新發現，為了避免人類的“驅逐”，田間的稗草們竟學會了“偽裝”。幾千年來，它們與水稻越長越像，從原來松垮貼地的懶樣子，進化出了
迄今分辨率最高的野生稻栽培稻泛基因組圖譜繪就
亞洲栽培稻馴化歷史可追溯至一萬年前的普通野生稻。 面對全球人口增長和氣候變化加劇的雙重壓力，如何將野生稻歷經萬年錘煉的“生存智慧”注入現代品種，培育出兼具高產潛力與抗病抗逆特性的“超級水稻”已成為重要研究課題。然而，傳統依賴單一參考基因組的研究模式譬如以管窺天，僅能捕捉水稻遺傳多樣性的冰山一角。
除不盡的雜草：我進化千年，越來越有“稻”樣
稗草（Echinochloa crus-galli ）是田間頭號雜草，為了除掉它，人類已經努力了幾千年。浙江大學農業生物與技術學院樊龍江教授團隊與中國水稻所等單位合作研究最新發現，為了避免人類的“驅逐”，田間的稗草們竟學會了“偽裝”。幾千年來，它們與水稻越長越像，從原來松垮貼地的懶樣子，進化出了
家養與養殖有何區別？“家養”的肉一定更好嗎？
“家養”肉，不一定更好 許多人看到“純天然”“家養”等字眼就會將其與“無公害”等同起來，但事實并非如此。 所謂“無公害”是指在生產過程中嚴格按照國家相關法律法規的規定和標準，從培育到圈舍設計、飼料生產、飼養管理、疫病防治、屠宰加工、儲存、運輸等各個環節都經過有效而嚴格的管理控制，肉品在感官指
昆明植物所在進化起源方向最新進展
在植物進化的特定時期，植物獲得了生產結構豐富且功能多樣的天然產物的能力，呈現出結構相似的天然產物集中于系統發育樹上近源物種的分布特征。而部分結構相似的天然產物卻零散地分布于系統發育樹上遠源物種中，如托品烷生物堿、類固醇和環烯醚萜等。當前，科學家主要通過單個酶的獨立進化來闡明天然產物零散的分布特征。實