脈沖場凝膠電泳的分子質量標準
實驗方法原理 PFGE 用于分離很大的 DNA 分子,因而需要很高分子質量的標準。這種標準可以按照 Lauer 等(1977 ) 介紹的方法從噬菌體,如 T7 (40kb)、T2 (166kb)和 G (758kb) 提取獲得。但是一個更好的覆蓋范圍更廣的系列標準是 λ 噬菌體 DNA 的系列串聯體。后面介紹的具體步驟是 Vdlrath 和 Davis (1987) 方法的改進。實驗材料 噬菌體 T4 DNA 連接酶純化的噬菌體 λDNA試劑、試劑盒 ATPDithiothreitolEDTA連接緩沖液低熔點瓊脂糖緩沖液聚乙二醇TE儀器、耗材 低熔點(LMT ) 瓊脂糖Tygon 管水浴實驗步驟 一、材料1. 緩沖液和溶液ATP ( 0.1 mol/L)Dithiothreitol ( 1 mol/L)EDTA ( 0.5 mol/L, pH 8.0)含聚乙二醇的 1X 連接緩沖液(50 mmol/L Tris-Cl......閱讀全文
脈沖場凝膠電泳
脈沖場凝膠電泳1)高分子量DNA瓊脂糖凝膠塊制備和加工1.收集10ml全血,加入30ml細胞裂解液。置冰浴中至少20min直至紅細胞完全溶解。2.2000r/min離心10min,移去紅色上清液,再次用細胞裂解液洗滌細胞,然后用PBS重懸細胞。3.稀釋單細胞懸液并取一小份用Neubauer腔計數細胞
脈沖場凝膠電泳實驗
實驗材料 DNA試劑、試劑盒 GTBETBE瓊脂糖儀器、耗材 電泳儀實驗步驟 1. ?制備用于水平電泳的1%瓊脂糖凝膠,放入電泳裝置,其上覆蓋以2~3 mm 的GTBE或TBE緩沖液。?2. ?加入液體樣品。裝好蠕動泵用于電泳緩沖液循環。3. ?對于微型凝膠調整循環速度至5~10 ml/min 對于
脈沖場凝膠電泳實驗
實驗概要了解脈沖場凝膠電泳(PFGE)的工作原理,并學習和掌握有關的操作技術。實驗原理大分子DNA(一般長度超過20kb,在某些情況下,超過40kb)在電場作用下通過孔徑小于分子大小的凝膠時,將會改變無規卷曲的構象,沿電場方向伸直,與電場平行從而才能通過凝膠。此時,大分子通過凝膠的方式相同,遷移率無
脈沖場凝膠電泳的應用
脈沖場凝膠電泳在生物基因分型、分子流行病學研究、細胞凋亡、追蹤傳染源、獸醫流行病診斷輔助、食品和公共健康及染色體DNA分離等研究中有廣泛應用。追蹤傳染源脈沖場凝膠電泳用于評估同一事件中不同來源菌株可能存在的關系,是溯源的有用技術之一。當疫情爆發時, 為了采取有針對性的措施,對該疫情進行合理有效地防控
脈沖場凝膠電泳(PFGE)概述
脈沖場凝膠電泳(PFGE)的原理大致為:細菌包埋于瓊脂塊中,用適當的內切酶在原位對整個細菌染色體進行酶切,酶切片段在特定的電泳系統中通過電場方向不斷交替變換及合適的脈沖時間等條件下而得到良好的分離。PFGE中內切酶的選用至關重要,所采用的內切酶常為寡切點酶(lowfrequencycleavager
脈沖場凝膠電泳(PFGE)實驗
實驗概要本實驗利用脈沖場凝膠電泳(PFGE)分離了大分子DNA。實驗原理大分子DNA(一般長度超過20kb,在某些情況下,超過40kb)在電場作用下通過孔徑小于分子大小的凝膠時,將會改變無規卷曲的構象,沿電場方向伸直,與電場平行從而才能通過凝膠。此時,大分子通過凝膠的方式相同,遷移率無差別(也稱“極
脈沖場凝膠電泳(PFGE)概述
脈沖場凝膠電泳(PFGE)的原理大致為:細菌包埋于瓊脂塊中,用適當的內切酶在原位對整個細菌染色體進行酶切,酶切片段在特定的電泳系統中通過電場方向不斷交替變換及合適的脈沖時間等條件下而得到良好的分離。PFGE中內切酶的選用至關重要,所采用的內切酶常為寡切點酶(low frequency cle
橫向交變場的脈沖場凝膠電泳
實驗方法原理 Gardiner 等(1986; Gardiner and Patterson 1989) 使用置于垂直凝膠兩側的兩組鉑線電極的凝膠電泳裝置以分離大的 DNA 片段。在這種橫向交變場電泳(transverse alternating field electrophoresis,
橫向交變場的脈沖場凝膠電泳
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 Gardiner 等(1986; Gardiner and Patterson 1989) 使用置于垂直凝膠兩側的兩組鉑線電極的凝膠電泳裝置以分離大的 DNA 片段。在這種橫向交變場電泳(transverse alterna
向交變場的脈沖場凝膠電泳
Gardiner 等(1986; Gardiner and Patterson 1989) 使用置于垂直凝膠兩側的兩組鉑線電極的凝膠電泳裝置以分離大的 DNA 片段。在這種橫向交變場電泳(transverse alternating field electrophoresis, TAFE) 中 ,當
脈沖場凝膠電泳實驗——倒轉電場
脈沖場凝膠電泳是在兩個不同方向的電場周期性交替進行的,可分離長至5Mb的DNA分子,其工作原理是DNA分子在交替變換方向的電場中作出反應所需的時間取決于它的大小。較小的分子重新定向較快,因而在凝膠中移動也較快,于是不同大小的分子被成功分離。實驗材料DNA試劑、試劑盒GTBETBE瓊脂糖儀器、耗材電泳
脈沖場凝膠電泳的應用領域
脈沖場凝膠電泳在生物基因分型、分子流行病學研究、細胞凋亡、追蹤傳染源、獸醫流行病診斷輔助、食品和公共健康及染色體DNA分離等研究中有廣泛應用。追蹤傳染源脈沖場凝膠電泳用于評估同一事件中不同來源菌株可能存在的關系,是溯源的有用技術之一。當疫情爆發時, 為了采取有針對性的措施,對該疫情進行合理有效地防控
箝位勻強電場的脈沖場凝膠電泳
實驗方法原理 箝位勻強電場(contour-clamped homogeneous electric field, CHEF) 凝膠電泳中, 電場是由多個電極產生的。這些電極圍繞水平凝膠呈四邊形或六邊形,其電位被箝制在頂先設定的水平(Chuetal. 1986; Vollrath and
箝位勻強電場的脈沖場凝膠電泳
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 箝位勻強電場(contour-clamped homogeneous electric field, CHEF) 凝膠電泳中, 電場是由多個電極產生的。這些電極圍繞水平凝膠呈四邊形或六邊形,其電位被箝制在頂先設定的水平(Ch
脈沖場凝膠電泳的分子質量標準
PFGE 用于分離很大的 DNA 分子,因而需要很高分子質量的標準。這種標準可以按照 Lauer 等(1977 ) 介紹的方法從噬菌體,如 T7 (40kb)、T2 (166kb)和 G (758kb) 提取獲得。但是一個更好的覆蓋范圍更廣的系列標準是 λ 噬菌體 DNA 的系列串聯體。后面介紹的具
脈沖場凝膠電泳的分子質量標準
實驗方法原理 PFGE 用于分離很大的 DNA 分子,因而需要很高分子質量的標準。這種標準可以按照 Lauer 等(1977 ) 介紹的方法從噬菌體,如 T7 (40kb)、T2 (166kb)和 G (758kb) 提取獲得。但是一個更好的覆蓋范圍更廣的系列標準是 λ 噬菌體 DNA
箝位勻強電場的脈沖場凝膠電泳
箝位勻強電場(contour-clamped homogeneous electric field, CHEF) 凝膠電泳中, 電場是由多個電極產生的。這些電極圍繞水平凝膠呈四邊形或六邊形,其電位被箝制在頂先設定的水平(Chuetal. 1986; Vollrath and Davis 1987;
脈沖場凝膠電泳的分子質量標準
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 PFGE 用于分離很大的 DNA 分子,因而需要很高分子質量的標準。這種標準可以按照 Lauer 等(1977 ) 介紹的方法從噬菌體,如 T7 (40kb)、T2 (166kb)和 G (758kb) 提取獲得。但是一個更
脈沖場凝膠電泳制備DNA(酵母完整DNA的分離)
制備用于電泳的酵母 DNA,先用酶破壞酵母細胞胞壁,然后在熔化的低熔點瓊脂糖中混懸,制成栓。將栓浸入含蛋白酶的裂解緩沖液,以加速細胞裂解和除去蛋白質。此方法在 Schwartz 和 Cantor (1984) 最初介紹的方法上略有改進,它可用于制備作為 高分子質量標準的酵母染色體和酵母人工染色體(Y
脈沖場凝膠電泳制備DNA(酵母完整DNA的分離)
實驗方法原理 制備用于電泳的酵母 DNA,先用酶破壞酵母細胞胞壁,然后在熔化的低熔點瓊脂糖中混懸,制成栓。將栓浸入含蛋白酶的裂解緩沖液,以加速細胞裂解和除去蛋白質。此方法在 Schwartz 和 Cantor (1984) 最初介紹的方法上略有改進,它可用于制備作為 高分子質量標準的酵母
脈沖場凝膠電泳制備DNA(酵母完整DNA的分離)
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 制備用于電泳的酵母 DNA,先用酶破壞酵母細胞胞壁,然后在熔化的低熔點瓊脂糖中混懸,制成栓。將栓浸入含蛋白酶的裂解緩沖液,以加速細胞裂解和除去蛋白質。此方法在 Schwartz 和 Cantor (1984) 最初介紹的
脈沖場凝膠電泳能用來進行微生物鑒定嗎
你已經得到了這株菌是嗎?形態,生理生化結合分子生物學鑒定即可。如果沒有形態分類學基礎,可以直接先做分子鑒定,比對后看大概屬于哪個種后再詳細分析。分子鑒定步驟:1.液體培養細菌,一般條件37度24小時即可。2.菌液PCR。擴增16SrDNA序列,所用引物網上都有,查到后,將序列發送生物公司合成。pcr
脈沖場凝膠電泳制備DNA(哺乳動物細胞和組織DNA的分離)
實驗方法原理 本方案敘述了從培養細胞和組織制備 DNA 樣品的方法。病人或動物來源的白細胞也能用作 PFGE 的高分子質量 DNA 樣品。如果確有必要,DNA 也可以從哺乳動物細胞分離出的胞核制備。經驗表明:從胞核制備 DNA 沒有優點,因為從完整細胞制備的 DNA 同樣易于酶切。實驗材料
脈沖場凝膠電泳制備DNA(哺乳動物細胞和組織DNA的分離)
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 本方案敘述了從培養細胞和組織制備 DNA 樣品的方法。病人或動物來源的白細胞也能用作 PFGE 的高分子質量 DNA 樣品。如果確有必要,DNA 也可以從哺乳動物細胞分離出的胞核制備。經驗表明:從胞核制備 DNA 沒有優點,
脈沖場凝膠電泳制備DNA(哺乳動物細胞和組織DNA的分離)
本方案敘述了從培養細胞和組織制備 DNA 樣品的方法。病人或動物來源的白細胞也能用作 PFGE 的高分子質量 DNA 樣品。如果確有必要,DNA 也可以從哺乳動物細胞分離出的胞核制備。經驗表明:從胞核制備 DNA 沒有優點,因為從完整細胞制備的 DNA 同樣易于酶切。本實驗來源「分子克隆實驗指南第三
脈沖場電泳儀基本操作
電泳前半小時進行以下工作:1.檢查冷凝系統,確認管道連接密閉,不漏氣。2.在電泳槽內加入約2.2升合適的電泳液。3.接通主機和冷凝泵電源,開啟主機開關,主機自檢結束后,開啟冷凝系統開關按“set temp”鍵調節需要的電泳溫度,按“actual temp”顯示實際溫度。調節泵的速度為“100”左右。
脈沖電場凝膠電泳的定義
脈沖電場凝膠電泳(pulsed-field gel electrophoresis),在脈沖電場中,DNA分子的遷移方向隨著電場方向的周期性變化而不斷改變。
脈沖[交變]電場凝膠電泳
中文名稱脈沖[交變]電場凝膠電泳英文名稱pulse [alternative] field gel electrophoresis定 義利用脈沖電場的作用在凝膠介質中分離大分子DNA的一種電泳方法。由于超過一定大小(大于40 kb)的線狀DNA分子在瓊脂糖凝膠中電泳的速度幾乎相同,無法在恒場強凝膠
交變脈沖電場凝膠電泳
一般瓊脂糖凝膠電泳只能分離小于20kb的DNA。這是因為在瓊脂糖凝膠中,DNA分子的有效直徑超過凝膠孔徑時,在電場作用下,迫使DNA變形擠過篩孔,而沿著泳動方向伸直,因而分子大小對遷移率影響不大。如此時改變電場方向,則DNA分子必須改變其構象,沿新的泳動方面伸直,而轉向時間與DNA分子大小關系極為密
脈沖電場凝膠電泳的定義
PFGE:脈沖電場凝膠電泳(pulsed-field gel electrophoresis),在脈沖電場中,DNA分子的遷移方向隨著電場方向的周期性變化而不斷改變。在標準的PFGE中,第一個脈沖的電場方向在另一側成45°夾角。由于瓊脂糖凝膠的電場方向、電流大小及作用時間都在交替變化,使得DNA分子