國內外專家點評第一代基因組設計的雜交馬鈴薯
北京時間2021年6月24日晚23時，《細胞》在線發表了中國農業科學院深圳農業基因組研究所（以下稱“基因組所”）黃三文團隊完成的論文——“雜交馬鈴薯的基因組設計”，這是“優薯計劃”實施以來取得的里程碑式突破。 馬鈴薯是世界上最重要的塊莖類糧食作物，全球有13億人口以馬鈴薯為主食。與谷物類糧食作物不同，栽培馬鈴薯是依靠薯塊進行無性繁殖的同源四倍體物種。 由于四倍體遺傳的復雜性，馬鈴薯的遺傳改良進程緩慢，一些上百年歷史的馬鈴薯品種仍然在廣泛種植。 馬鈴薯產業面臨的另外一個挑戰是薯塊的繁殖系數低、儲運成本高、易攜帶病蟲害。 為了徹底解決馬鈴薯產業面臨的問題，黃三文團隊聯合云南師范大學等國內外優勢單位發起了“優薯計劃”，即運用“基因組設計”的理論和方法體系培育雜交馬鈴薯，用二倍體育種替代四倍體育種，并用雜交種子繁殖替代薯塊繁殖。這是馬鈴薯育種和繁殖的新底層技術，是對馬鈴薯產業的顛覆性創新。 黃三文告訴《中國科學報》，要實現......閱讀全文
國內外專家點評第一代基因組設計的雜交馬鈴薯
北京時間2021年6月24日晚23時，《細胞》在線發表了中國農業科學院深圳農業基因組研究所（以下稱“基因組所”）黃三文團隊完成的論文——“雜交馬鈴薯的基因組設計”，這是“優薯計劃”實施以來取得的里程碑式突破。 馬鈴薯是世界上最重要的塊莖類糧食作物，全球有13億人口以馬鈴薯為主食。與谷物類糧食
國內外專家點評第一代基因組設計的雜交馬鈴薯
北京時間2021年6月24日晚23時，《細胞》在線發表了中國農業科學院深圳農業基因組研究所（以下稱“基因組所”）黃三文團隊完成的論文——“雜交馬鈴薯的基因組設計”，這是“優薯計劃”實施以來取得的里程碑式突破。 馬鈴薯是世界上最重要的塊莖類糧食作物，全球有13億人口以馬鈴薯為主食。與谷物類糧食作
馬鈴薯雜交育種獲重要突破
? ? ? ?馬鈴薯是人們餐桌上的常客，但對育種家來說，培育優質馬鈴薯品種是個難題。北京時間2023年5月4日，國際學術期刊《細胞》在線發表了中國農業科學院深圳農業基因組研究所黃三文團隊的最新成果，通過追蹤最長8000萬年、累計12億年的馬鈴薯基因組進化痕跡，繪制了首個馬鈴薯有害突變的基因二維圖譜。
“理想型”翻開馬鈴薯雜交育種新篇章
“馬鈴薯是典型的無性繁殖作物，基因組高度雜合，存在大量有害變異，只有系統揭示馬鈴薯的基因組特征，才能有效實現無性繁殖作物的有性化育種。”中國科學院院士、中國農業科學院深圳農業基因組研究所（以下簡稱基因組所）研究員黃三文告訴《中國科學報》，有性繁殖的作物能夠通過雜交改良性狀，大大提高育種效率。
馬鈴薯基因組序列框架圖全球發布
中國科學家的創新性思路助推測序工作提前完成 9月23日，由14國科學家組成的“國際馬鈴薯基因組測序協作組”分別在北京、阿姆斯特丹、倫敦、紐約、利馬等地同時宣布了馬鈴薯基因組序列框架圖的完成。此次公布的馬鈴薯基因“藍圖”繪制工作的中國參與單位主要來自中國農業科學院蔬菜花卉所和深圳華大基因研究院。
基因組研究揭示歐洲馬鈴薯進化史
近日，來自德國、秘魯、英國和西班牙的一個國際研究團隊，對大量的馬鈴薯品種進行了測序，以了解更多關于現代歐洲馬鈴薯的歷史。在他們6月24日發表在Nature Ecology and Evolution上的論文中，該團隊描述了他們對馬鈴薯歷史的研究以及新發現。 過去的研究表明，馬鈴薯是在17世紀被
我科學家主導完成馬鈴薯基因組測序
7月15日，中國農業科學院公布，經過6年努力，由14個國家97名研究人員組成的“馬鈴薯基因組測序國際協作組”日前完成了馬鈴薯基因組測序。由中方團隊主導的這項研究，奠定了中國在這一研究領域的領先地位。 7月14日，國際權威學術期刊《自然》以封面文章的形式發表了馬鈴薯全基因組序列
比較基因組雜交芯片介紹
比較基因組雜交芯片（Comparative Genomic Hybridization Array）、基于芯片的比較基因組雜交（Microarray-based comparative genomic hybridization）或者陣列比較基因組雜交技術（array comparative g
比較基因組雜交芯片介紹
比較基因組雜交芯片（Comparative Genomic Hybridization Array）、基于芯片的比較基因組雜交（Microarray-based comparative genomic hybridization）或者陣列比較基因組雜交技術（array comparative gen
比較基因組雜交方法介紹
比較基因組雜交是將消減雜交、熒光原位雜交相結合，用于檢測DNA序列的拷貝數變異并將其定位在染色體上的方法。CGH?只能檢測不平衡的染色體改變。結構染色體變異，例如：平衡的相互易位或倒位不能被檢測出來，因為拷貝數沒有變化。CGH最初設計是用來檢測單一副本缺失的，所以它的的區帶長度至少5～10Mbarr
多個有害突變導致馬鈴薯自交衰退
自交衰退在異花授粉植物中是一種普遍存在的現象：在進行連續多代自交后，會出現生理機能的衰退，表現為生長勢減弱、產量降低。 當地時間1月14日，《自然—遺傳學》雜志在線發表了云南師范大學馬鈴薯科學研究院與中國農業科學院農業基因組研究所（以下簡稱基因組所）共同完成的馬鈴薯自交衰退遺傳機制解析成果。這
全基因組的比較基因組雜交技術介紹
Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a
黃三文：用大數據精準培育“你的菜”
在中國農業科學院深圳農業基因組研究所研究員黃三文辦公室的一面白色玻璃隔斷上，用馬克筆寫著一組雜交育種模式圖。這是多年前，他寫下的關于“優薯計劃”的創想。 雜交育種是將父母本雜交，形成不同的遺傳多樣性，再通過對雜交后代的篩選，獲得具有父母本優良性狀、且不帶有父母本中不良性狀的新品種的育種方法。馬
馬鈴薯育種的“火眼金睛”
馬鈴薯是最重要的塊莖類糧食作物，也是我國第四大主糧作物，全球有13億人以馬鈴薯為主食。但你可能不知道的是，我們在快餐店吃的薯條，其實全都來自120年前育成的一個馬鈴薯品種，背后的重要原因之一馬鈴薯的育種進程十分緩慢。 5月4日，國際權威期刊《細胞（Cell）》在線發表了中國農業科學院深圳農業基
中國農科院發布2021年度10項重大科學發現
1月12日，中國農業科學院舉辦2022年工作會議，會上發布了該院2021年度的10項重大科學發現，包括首獲證實植物到動物的功能基因轉移、首次發現烷基型產甲烷古菌、第一代基因組設計的雜交馬鈴薯問世等。具體如下：1.首獲證實植物到動物的功能基因轉移 4月1日《細胞》以封面文章出版蔬菜花卉所張友軍團隊
LexA酵母雙雜交系統的設計原理
?LexA酵母雙雜交系統的設計原理?報告質粒p8op-LacZ的GAL4 UAS編碼序列被完全去除，因此在缺乏LexA融合激活劑的情況下，報告基因LacZ的轉錄活性為零，該基因的篩選標志為URA3，可以作為有自主復制能力的質粒存在于酵母EGY48菌株中，也可以被整合到EGY48基因組DNA上。質粒p
基因組原位雜交的概念
中文名稱基因組原位雜交英文名稱genomic in situ hybridization;GISH定 義用核酸探針進行原位雜交，確定與探針互補的DNA序列在基因組上的位置。應用學科遺傳學（一級學科），基因組學（二級學科）
基因組DNA－Southern雜交操作步驟
1）基因組DNA Southern印跡的制備 預備 1．用適當的限制性內切酶消化基因組DNA樣品（10μg）。 2．進行瓊脂糖凝膠電泳。一般用0.7～1.0％的瓊脂糖凝膠分離基因組DNA，它在1～15kb的范圍內有較好的分辨率，可選用TBE或TAE緩沖液。瓊脂糖凝膠電泳需在1V/cm的電
《2022中國農業科學重大進展》報告發布
12月16日，2022中國農業農村科技發展高峰論壇暨中國現代農業發展論壇在北京召開。論壇上發布了《2022中國農業科學重大進展》報告，該報告由中國農業科學院科技管理局和農業信息研究所科技情報分析與評估創新團隊研制，遴選了10項能夠充分代表2021年我國農業科技前沿研究水平、取得重大突破性進展的基礎科
云南師范大學Nature－Genetics發文：自交衰退的遺傳基礎
研究人員發表了題為“The genetic basis of inbreeding depression in potato”的文章，公布了“優薯計劃”的最新成果：用二倍體替代四倍體，并用雜交種子替代薯塊，對馬鈴薯的育種和繁殖方式進行顛覆性創新。 馬鈴薯是世界上最重要的塊莖類糧食作物。與其它谷
馬鈴薯瓊脂
成分 馬鈴薯(去皮切塊) 200g 瓊脂 20g 蒸餾水 1000mL制法 同馬鈴薯葡萄糖瓊脂。?用途 鑒定霉菌用。
馬鈴薯基因組完成圖揭示復雜區域存在重要農藝性狀相關
中國農業科學院蔬菜花卉研究所馬鈴薯遺傳育種與栽培創新團隊和蔬菜分子設計育種創新團隊，對馬鈴薯單倍型DM的基因組進行了全序列組裝，獲得了包含24個端粒和12個著絲粒完整序列的馬鈴薯單倍型DM的端粒到端粒（T2T）的基因組完成圖（DM8.1），并在之前馬鈴薯基因組未能完整組裝的高度重復序列區域中，發
世界重大害蟲馬鈴薯塊莖蛾高質量基因組破譯
?馬鈴薯塊莖蛾形態特征和危害癥狀。中國農科院植保所供圖 近日，中國農業科學院植物保護研究所經濟作物蟲害監測與防控創新團隊聯合國內外多家單位，組裝了茄科作物的世界重大害蟲馬鈴薯塊莖蛾的染色體水平高質量基因組，相關研究結果發表在Nature旗下刊物《科學數據》（Scientific Data）。 馬鈴薯
馬鈴薯單倍體誘導系創制成功
近日，中國農業科學院深圳農業基因組研究所研究員黃三文團隊在《生物技術通報（英文）》（aBIOTECH）雜志上發表了研究成果。報道了利用雙單倍體技術構建高純度二倍體馬鈴薯自交系的方法體系，為二倍體馬鈴薯雜交育種提供了強有力的技術保障。 馬鈴薯是世界上最重要的塊莖類糧食作物，全球約有13億人以馬鈴薯
馬鈴薯單倍體誘導系創制成功
近日，中國農業科學院深圳農業基因組研究所研究員黃三文團隊在《生物技術通報（英文）》（aBIOTECH）雜志上發表了研究成果。報道了利用雙單倍體技術構建高純度二倍體馬鈴薯自交系的方法體系，為二倍體馬鈴薯雜交育種提供了強有力的技術保障。 馬鈴薯是世界上最重要的塊莖類糧食作物，全球約有13億人以馬鈴
泛基因組：賦能未來作物育種的基石
?繪圖：黃怡可 泛基因組（Pan-genome）是一個物種內所有基因組信息的總和，它比單一參考基因組涵蓋了更多的遺傳多樣性。 近年來，科學家已經獲得了多個作物的泛基因組。如何利用這些更為全面的基因組信息培育下一代良
泛基因組：賦能未來作物育種的基石
?繪圖：黃怡可 泛基因組（Pan-genome）是一個物種內所有基因組信息的總和，它比單一參考基因組涵蓋了更多的遺傳多樣性。 近年來，科學家已經獲得了多個作物的泛基因組。如何利用這些更為全面的基因組信息培育下一代良
馬鈴薯單倍型DM基因組全序列完成圖組裝成功
中國農業科學院蔬菜花卉研究所馬鈴薯遺傳育種與栽培創新團隊和蔬菜分子設計育種創新團隊，對馬鈴薯單倍型DM的基因組進行了全序列組裝，獲得了包含24個端粒和12個著絲粒完整序列的馬鈴薯單倍型DM的端粒到端粒（T2T）的基因組完成圖（DM8.1），并在之前馬鈴薯基因組未能完整組裝的高度重復序列區域中，發現了
如何設計特異性熒光原位雜交探針
1.探針分為好多種，你要先決定你用何種，是RNA探針還是DNA探針，雜交時，RNA－RNA結合的穩定性要比DNA－RNA好，所以RNA探針具有結合牢固、背景低等優點；DNA探針背景稍微深一些，不過也可以，標記方法比前者簡單一些，另外還有寡核苷酸探針，此類探針分子量小，通透性好，但就是標記的敏感性
細胞遺傳學——比較基因組雜交(CGH)
·?????????Comparative Genomic Hybridization (CGH) CGH is a molecular Cytogenetic method of screening a tumor for genetic changes. The alterations are