上藥所揭示KRAS突變腫瘤的分子分型和精準治療新策略
8月9日，中國科學院上海藥物研究所研究員譚敏佳和研究員黃敏團隊合作，在Molecular Cell上在線發表了題為A proteomic and phosphoproteomic landscape of KRAS mutant cancers identifies combination therapies的研究論文。該研究揭示出KRAS突變腫瘤的分子分型和精準治療新策略。 KRAS是人類惡性腫瘤中突變率最高的致癌基因之一，是肺癌、結直腸癌、胰腺癌等高死亡率腫瘤的重要癌驅動基因。KRAS突變腫瘤的治療在腫瘤研究領域備受關注，然而，由于KRAS蛋白自身的難靶向性和下游信號通路的復雜代償及反饋調節效應，針對KRAS突變腫瘤的精準治療面臨較大挑戰。KRAS突變通過持續激活細胞內的大量磷酸化信號轉導通路，促進腫瘤發生發展。在KRAS突變的基因背景下，全景描繪腫瘤的蛋白質組和磷酸化修飾信號通路，有望帶來KRAS突變腫瘤的分子分型的......閱讀全文
腫瘤突變靶向藥物療效受突變類型及腫瘤組織環境影響！
一大群來自美國、西班牙和澳大利亞的科學家發現旨在靶向特殊基因突變的抗癌藥物的療效依賴于涉及的腫瘤組織的類型以及基因突變的性質。在他們這項發表于《Nature》的新研究中，研究人員描述了他們的臨床試驗和結果。來自美國國家兒童醫院遺傳醫學研究所的Elaine Mardis對這項研究進行了評論，并就癌
腫瘤免疫療法——多突變癌癥克星
臨床試驗中使用的新型免疫系統激活抗癌藥物讓許多看似無法治愈的黑素瘤或肺癌患者重獲新生，但這些藥物對結腸癌似乎無效。不過有一個例外——一位男性患者的結腸癌轉移瘤在2007年接受藥物治療后消失了——引起了研究人員的興趣。他們懷疑該患者之所以能夠康復，可能與腫瘤中出現大量突變有關。如今，一個小型臨床試
針對充斥突變腫瘤的免疫療法
新的增強免疫系統的治癌藥物，在臨床試驗中拯救了許多看似無法治療的黑色素瘤和肺癌患者的生命，但對結腸癌似乎沒有療效。一男性結腸癌患者是個例外，2007年治療后，他的轉移性腫瘤消失了好幾年，這激起了研究人員的興趣。他們懷疑，該患者的康復可能與其腫瘤中存在大量突變有關。現在，一個小型的臨床試驗表明，甚
AJRCCM：利用唾液也能檢測腫瘤突變？
AJRCCM：利用唾液也能檢測腫瘤突變？ 目前篩選肺癌突變是利用血漿或血液來進行測試，但血液成分復雜。近日一項科學研究證實電場誘導釋放和測量（electric field-induced release and measurement，EFIRM）是一種新的
如何快速發現腫瘤中的熱點突變
去年10月，Ion Torrent推出了Ion AmpliSeq? Cancer Panel，它覆蓋了46個癌基因的相關區域。如今，Ion AmpliSeq? Cancer Hotspot Panel v2如今經過擴展，靶定50個癌基因和腫瘤抑制
基于SDHB突變自發PC/PG腫瘤的大鼠模型及腫瘤細胞的建立...
基于SDHB突變自發PC/PG腫瘤的大鼠模型及腫瘤細胞的建立及意義
這個“正常”器官的基因突變比腫瘤還多
難以置信…… 日前，來自英國惠康桑格研究所（Wellcome Sanger Institute）和劍橋大學（University of Cambridge）的一支科研團隊在頂尖學術期刊《自然》上發表了一篇新論文，科學家們首次從基因組的角度詳細地分析了一個特殊的人體器官——胎盤。 這些研究數據
－利用腫瘤細胞的基因突變制備癌癥疫苗
個性化疫苗為治療多對基因突變引發的癌癥提供新的選擇。 在一個小型臨床試驗中，利用在腫瘤細胞中的突變蛋白所制備的疫苗成功地引發了機體對癌細胞的免疫應答反應。 該結果是目前致力于研發個性化癌癥治療所得出的最新成果，并公布于4月2日的科學（Science）雜志中。在此次試驗中，三位惡性黑色素瘤患者
阿司匹林防癌嗎？保護DNA－防腫瘤細胞突變
目前醫學界對于阿司匹林防癌的共識是，在進一步推廣之前，有這么幾個問題需要明確回答：應當在什么年齡服用，服用年限是多久，劑量如何控制? 自1897年問世以來，阿司匹林的傳奇就從未完結。 若以50mg藥片計算，全球每年消耗阿司匹林將超過1000億片，無怪乎它在1950年就以“銷量最高的藥
什么是磷酸化與去磷酸化
磷酸化，將磷酸基團加在中間代謝產物上或加在蛋白質（protein）上的過程。其中除去磷酸基團的酶稱為磷酸酶。 蛋白質磷酸化可發生在許多種類的氨基酸（蛋白質的主要單位）上，其中以絲氨酸為多，接著是蘇氨酸。去磷酸化：磷酸基團的除去，對許多生物起著“開/關”作用。防止質粒載體的自身連接，最常用于質粒進行單
上藥所揭示KRAS突變腫瘤的分子分型和精準治療新策略
8月9日，中國科學院上海藥物研究所研究員譚敏佳和研究員黃敏團隊合作，在Molecular Cell上在線發表了題為A proteomic and phosphoproteomic landscape of KRAS mutant cancers identifies combination th
推進BRAF基因突變檢測－提高臨床腫瘤診療水平
日前，在“中華醫學會病理學分會第二十一次學術會議暨第五屆中國病理年會”期間，中國醫學科學院腫瘤醫院病理科教授應建明分享了BRAF基因突變檢測在甲狀腺癌、結直腸癌等實體瘤鑒別診斷、治療指導及預后管理方面的重要意義以及免疫組化BRAF V600E抗體檢測方法的臨床應用。 應建明表示：“在
關于p53基因的突變與腫瘤的介紹
P53基因與人類50%的腫瘤有關，有肝癌、乳腺癌、膀胱癌、胃癌、結腸癌、前列腺癌、軟組織肉瘤、卵巢癌、腦瘤、淋巴細胞腫瘤、食道癌、肺癌、成骨 肉瘤等，人類腫瘤中P53突變主要在高度保守區內，以175、248、249、273、282位點 突變最高，不同種類腫瘤不同，如結腸癌和乳腺癌有相似的流行病學
如何查看抗體是磷酸化還是非磷酸化
磷酸化和非磷酸化的抗體主要區別有： 1.磷酸化抗體的檢測的是出于活性狀態（磷酸化）的蛋白。 2.磷酸化抗體只針對磷酸化位點設計，是一種位點特異性的多抗，這到有些單抗的特性。3.普通抗體的合成（多抗）：原核表達蛋白-〉純化-〉免疫動物-〉收獲抗體。 4.磷酸化抗體合成：人工合成含磷酸化位點的
酶的磷酸化與脫磷酸化的比較
磷酸化是一種常見的修飾形式。酶蛋白中帶羥基的氨基酸殘基Thr、Ser與Tyr可作為磷酸化修飾位點。磷酸化是由ATP提供磷酸基，并在蛋白激酶的催化下完成的。脫磷酸反應則是由磷酸酶的催化下完成的。有的酶在磷酸化修飾后活性增高，而另一些酶則在磷酸化修飾后活性反受抑制。由上可見，酶的化學修飾調節具有以下特點
Nature－子刊：當前分析方法會遺漏腫瘤中復雜突變
一項新研究表明，當前的基因組分析方法會系統性地錯過檢測癌癥患者腫瘤中某種類型的復雜突變。此外，相當大比例的這些復雜突變存在于可被一些現有藥物靶向的、眾所周知的癌基因中，這有可能會擴大受益癌癥患者的數量。 這項來自華盛頓大學醫學院的研究發布在12月14日的《自然醫學》（Nature Medici
研究提出適用中國人群腫瘤突變負荷檢測技術
西安交通大學計算機科學與技術學院生物信息管理與數字健康研究團隊與南京世和基因生物技術股份有限公司合作，提出了一種基于推薦思想的數據特征與檢測策略動態適配的腫瘤突變檢測方法。該方法基于元學習框架，根據測序數據在各個基因組區域的不同數據特征，智能化選擇最優的突變檢測策略，有效控制檢測策略錯配導致的樣本間
研究提出適用中國人群腫瘤突變負荷檢測技術
西安交通大學計算機科學與技術學院生物信息管理與數字健康研究團隊與南京世和基因生物技術股份有限公司合作，提出了一種基于推薦思想的數據特征與檢測策略動態適配的腫瘤突變檢測方法。該方法基于元學習框架，根據測序數據在各個基因組區域的不同數據特征，智能化選擇最優的突變檢測策略，有效控制檢測策略錯配導致的樣本間
研究發現p53突變促進腫瘤免疫逃逸關鍵機制
抑癌基因TP53（編碼p53蛋白）通常發揮腫瘤監查功能，TP53基因突變后轉變為癌基因，是多種腫瘤發生發展的驅動因素。近日，中國科學技術大學教授魏海明課題組發現，p53可以直接調控免疫細胞的發育、分化與功能，在腫瘤免疫微環境中發揮重要作用。p53突變導致腫瘤干細胞分泌白細胞介素34（IL-34），I
臨床測序重磅成果！300多種腫瘤，突變數據集問世
腫瘤分子分析是精準腫瘤醫學的基本組成部分，它能夠識別基因以及通路中所發生的變化，這是個性化醫療的關鍵。不同組織復發性突變的存在，加上分子靶向治療組合的擴大，這就需要靈活且綜合性的方法來分析全癌譜中與臨床相關的基因。 5月8日，Nature Medicine雜志在線發表了一篇“大作”，科學家們采
研究發現p53突變促進腫瘤免疫逃逸關鍵機制
抑癌基因TP53（編碼p53蛋白）通常發揮腫瘤監查功能，TP53基因突變后轉變為癌基因，是多種腫瘤發生發展的驅動因素。近日，中國科學技術大學教授魏海明課題組發現，p53可以直接調控免疫細胞的發育、分化與功能，在腫瘤免疫微環境中發揮重要作用。p53突變導致腫瘤干細胞分泌白細胞介素34（IL-34），I
Nature－Genetics丨腫瘤細胞突變水平或能預測免疫療法效果
近年來，免疫檢查點抑制劑（Immune checkpoint inhibitor，ICI）的使用，例如抗CTLA-4 以及抗PD-1/PD-L1單抗，給腫瘤治療帶來了革命性的變化【1】。但是，在接受ICI治療之后，只有一小部分病人能夠獲得持續的療效，最近的幾個大型臨床三期實驗也都報道了陰性結果【
磷酸化和非磷酸化的抗體什么區別
1.磷酸化抗體的檢測的是出于活性狀態（磷酸化）的蛋白。2.磷酸化抗體只針對磷酸化位點設計，是一種位點特異性的多抗，這到有些單抗的特性。3.普通抗體的合成（多抗）：原核表達蛋白-〉純化-〉免疫動物-〉收獲抗體。4.磷酸化抗體合成：人工合成含磷酸化位點的多肽-〉人工體外磷酸化-〉鏈接半抗原-〉免疫動物-
磷酸化和非磷酸化的抗體什么區別
磷酸化和非磷酸化的抗體主要區別有： 1.磷酸化抗體的檢測的是出于活性狀態（磷酸化）的蛋白。 2.磷酸化抗體只針對磷酸化位點設計，是一種位點特異性的多抗，這到有些單抗的特性。3.普通抗體的合成（多抗）：原核表達蛋白-〉純化-〉免疫動物-〉收獲抗體。 4.磷酸化抗體合成：人工合成含磷酸化位點的
抗體磷酸化與非磷酸化的區別與關系
非磷酸化是測該蛋白的含量，不能知道其活性狀態，抗體磷酸化是測該蛋白的磷酸化水平如何，側重于了解該蛋白的一種活性狀態。很多信號通路的蛋白在受到某些刺激后都是通過改變其磷酸化水平的改變而引起細胞的一系列反應，其蛋白含量并不見得會有多大的變化。首先要說明的就是檢測的蛋白質在你檢測的組織或者細胞中是表達的,
昆明動物所揭示線粒體DNA種系突變對腫瘤易感性的影響
線粒體DNA（mtDNA）在腫瘤發生發展中的作用多年來備受關注。前期研究揭示，大部分腫瘤細胞mtDNA體細胞突變很可能都是由于其線粒體氧化磷酸化功能限制降低而產生的副產品。而mtDNA種系突變不僅存在于腫瘤組織，同樣也存在于正常組織中。但是目前仍不清楚腫瘤細胞mtDNA種系突變是否和體細胞突變的
什么是磷酸化
磷酸化是將磷酸基團加在中間代謝產物上或加在蛋白質（protein）上的過程。其中除去磷酸基團的酶稱為磷酸酶。 蛋白質磷酸化可發生在許多種類的氨基酸（蛋白質的主要單位）上，其中以絲氨酸為多，接著是蘇氨酸。除了蛋白質以外，部分核苷酸，如三磷酸腺苷（ATP）或三磷酸鳥苷（GTP）的形成，也是經由二磷酸腺苷
磷酸化的和非磷酸化的抗體有什么不同
通常來說，磷酸化抗體芯片上檢測某一個磷酸化位點會設置一對抗體，即：磷酸化的和非磷酸化的抗體。說到區別，可能從制備講起你可以更加清晰一些。首先就是多肽合成，由于磷酸化位點的保守性，對某一個磷酸化位點周邊20個氨基酸左右的序列合成多肽，磷酸化多肽肯定帶有磷酸基團，非磷酸化多肽就掉了這個磷酸基團。然后就是
使用Azurespot分析軟件定量非磷酸化與磷酸化蛋白
??背景去除背景扣除對于有效定量是必不可少的。?例如，AzureSpot有五個自動后臺選項和三個手動選項。>?如果背景不均勻，請使用?Rolling Ball。 類似指定半徑的圓盤在泳道輪廓下“滾動”，對信號求平均，從而產生平滑小的變化。 半徑越大，滾動越平滑。>?如果輪廓的末端與輪廓的其余部分沒有
使用Azurespot分析軟件定量非磷酸化與磷酸化蛋白
在上期我們回顧了使用多重來成像磷酸化蛋白的技巧，在這部分中，我們將介紹使用Azurespot分析軟件進行定量。 背景去除 背景扣除對于有效定量是必不可少的。 例如，AzureSpot有五個自動后臺選項和三個手動選項。 > 如果背景不均勻，請使用 Rolling Bal