研究解析栽培草莓“祖先”的基因組圖譜
草莓具有重要的經濟和營養價值，現代八倍體栽培草莓起源于兩個八倍體野生種弗州草莓和智利草莓的種間雜交。近日，中國科學院昆明植物研究所研究員朱安丹專題組深入解析了八倍體草莓的起源和遺傳分化特征。相關研究成果在線發表于《自然-植物》。朱安丹表示，由于草莓屬系統發育解析涉及未知的祖先、同源染色體交換和不完全譜系分選等問題，學術界至今對八倍體草莓的二倍體祖先問題存在較大的爭議。此外，八倍體草莓在馴化過程中的亞基因組的同源偏向性表達及轉變模式并不明確。該研究提出了一套適用于多倍體的ALLHiC迭代掛載流程，構建了兩個八倍體野生草莓智利草莓和弗州草莓染色體水平的高質量分型基因組。研究人員完成了八倍體草莓亞基因組的分離，并在此基礎上采用不同的分析方法重新追溯了八倍體草莓的二倍體祖先。研究結果糾正了國外學者在亞基因組分配上的錯誤，并進一步確定森林草莓和飯沼草莓是八倍體草莓現存的二倍體祖先種。研究還探討了八倍體草莓在馴化過程中的同源偏向性表達分化，......閱讀全文
基因組學分析揭示
英國《自然》雜志18日在線公開的一篇基因組學論文顯示，來自西伯利亞阿爾泰山脈東部尼安德特人的祖先，和現代人祖先的相遇與交融繁殖可能比原先認為的更早。已有證據顯示，尼安德特人在47000年到65000年前在非洲之外就向現代人貢獻了遺傳物質。這項新研究還顯示，大約在10萬年前，現代人和尼安德特人之間
美印藥物基因組學與癌癥基因組學檢測商業化
美國Companiondx實驗室擬與健康信息技術服務商Enable Healthcare合作，向醫生推廣藥物基因組學檢測；印度癌癥醫學公司HCG宣布建立一個新的腫瘤基因中心，旨在下代測序技術能夠幫助定位腫瘤，從而提高化療和放療的效率和響應率 美國藥物基因組學檢測商業化 Companiondx實驗
Science專題：癌癥基因組學
在2001年完成人類基因組測序后，許多的研究人員立即將目光放到了利用這些信息來更好地了解遺傳學上。最近，越來越多的研究確定了表觀遺傳學在癌癥的發生、形成及發展過程中起效應。從鑒別與遺傳性癌癥相關的單基因變異的前基因組時代轉向，測序技術的進步使得研究人員能夠利用全基因組方法來檢測基因組間的差異，以
藥物基因組學的定義
藥物基因組學(pharmacogenomics),又稱基因組藥物學或基因組藥理學,是藥理學的一個分支,定義為在基因組學的基礎上,通過將基因表達或單核苷酸的多態性與藥物的療效或毒性聯系起來,研究藥物如何由于遺傳變異而產生不同的作用。
毒理基因組學的定義
毒理基因組學(toxicogenomics)是從多基因、全基因組水平研究毒物作用與基因表達的相互影響。其研究內容主要包括3個方面:促進環境應激原與疾病易感性關系的理解、闡明毒性分子機制、篩選和確認與疾病和毒物暴露相關的生物標志物(biomarkers)。
－Science：宏基因組學測序技術
宏基因組學技術(Metagenomic approaches)正快速拓寬我們對微生物代謝能力(microbial metabolic potential)的認識。 長期以來，對微生物(microorganism)功能開展的研究主要依賴的都是以在實驗室里培養的單一物種(individua
表觀基因組學研究指南（一）
今年九月，對于基因組研究者們來說是一個具有紀念意義的月份，因為美國人類基因組研究院(NHGRI)資助的ENCODE項目在Nature，Genome Biology，Genome Research等雜志上公布了三十多份論文，還有在Science，Cell，以及the Journal of Bi
基因組學:－跨越癌癥研究國界
1982年11月，在尼日利亞海軍醫院外足球場上踢球的一名軍官，突然摔倒死亡。這名男子被帶到急診室時，當時還是一個新人的 Olufunmilayo Funmi Olopade醫生正在值班。“我們搞不明白為什么他死亡，這讓我感到震驚，從那時開始我意識到，我需要做更多的工作來理解和幫助人們。”Ol
作物基因組學研究進展
摘要：農作物基因組學研究的發展，對于有效利用現代分子生物學手段進行物種的遺傳改良發揮了重要作用。隨著測序技術的發展，已經實現對重要農作物，如水稻、小麥、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因組的測序或重測序，在此基礎上完成對控制重要農藝性狀基因的克隆和鑒定。本文綜述了２０１７年度主要農作物基因組
表觀基因組學研究指南（三）
今年九月，對于基因組研究者們來說是一個具有紀念意義的月份，因為美國人類基因組研究院(NHGRI)資助的ENCODE項目在 Nature，Genome Biology，Genome Research等雜志上公布了三十多份論文，還有在Science，Cell，以及the Journal
基因組學推進腫瘤研究未來發展
——訪億明達腫瘤業務營銷副總裁約翰·萊特 基因組學正在改變腫瘤研究，其最終目標是推進癌癥的診斷、治療、監控及最終的篩查方式。 癌癥通常按照形態進行分類，這指的是病理學家在顯微鏡下看到的內容。“如今，癌癥分類依據已經開始從形態特征轉變為更有效的治療方式，其中的主要轉變在很大程度上歸功于基因組研
作物基因組學研究進展（一）
作物基因組學研究進展農作物基因組學研究的發展，對于有效利用現代分子生物學手段進行物種的遺傳改良發揮了重要作用。隨著測序技術的發展，已經實現對重要農作物，如水稻、小麥、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因組的測序或重測序，在此基礎上完成對控制重要農藝性狀基因的克隆和鑒定。本文綜述了２０１8年度主要農
基因組學出手－尋找番茄舊時味
近日，《科學》雜志以封面報道形式介紹了中美科學家關于番茄風味改良的化學和遺傳學路線圖研究成果，同期刊發了兩國科學家合作的論文。與此同時，《自然》雜志也就此在線發表了亮點報道。 小小番茄之所以獲得如此高的關注度，源于這種果實既是一種非常受消費者歡迎的蔬菜，又是植物生物學家的最愛之一，堪稱植物遺
當免疫治療遇到基因組學
近來一種能夠激活人體自身免疫系統對付腫瘤的新藥大獲成功，然而，只有部分癌癥患者得以受益。科學家們近來發現編碼肺部腫瘤的基因序列有可能能夠幫助我們預測免疫藥物能夠讓哪些人受益最多。 腫瘤細胞之所以能否逃脫人體免疫系統的監視，是通過激活了免疫T細胞表面一個叫做PD-1的受體。該受體被激活以后，T細
藥物基因組學發展和應用【四】
? 藥物基因組學為臨床醫生和臨床藥師提供了很大程度上改善幾百萬患者藥物治療效果的機會。但是，這個機會的利用卻受到阻礙和挑戰，并且新的知識還在不斷的更新。? ? 藥物受體的基因多態性? ? 一、β腎上腺素受體基因多態性? ? 目前認為至少存在β1、β2和β3三種不同的腎上腺素受體亞型，β1腎上腺素受體
作物基因組學研究進展（三）
⑸棉花基因組研究棉花是重要的天然纖維和油料作物，也是研究多倍體進化和作物馴化的重要模式植物。南京農業大學張天真等課題組通過將栽培棉與野生棉對比，繪制出了棉花表觀遺傳基因的“甲基化基因圖譜”，對野生棉和栽培棉之間超過１２００萬個的差異甲基化胞嘧啶進行分析，鑒定出５１９個表觀等位基因（ｅｐｉａｌｌｅｌｅ
藥物基因組學發展和應用【一】
影響患者對藥物反應的因素有很多，包括患者本身的內在因素如年齡、性別、種族/民族、遺傳、疾病狀態和器官功能，還有其它生理變化，包括懷孕、哺乳以及外源性因素如吸煙和飲食。基因變異可導致疾病表現和藥物反應的多樣性這一觀念目前已得到廣泛認可，并經許多的研究證實。對于一些遺傳因素影響研究比較明確的藥物，在治療
作物基因組學研究進展（二）
⑵小麥基因組研究小麥是全球最重要的糧食作物之一，小麥的穩產和增產對我國乃至全世界糧食安全的影響舉足輕重。近年來由于全球氣候變化、環境變化的影響，小麥生產面臨嚴峻的挑戰，對于小麥的育種和品種改良工作提出了新的要求。普通小麥（Ｔｒｉｔｉｃｕｍ ａｅｓｔｉｖｕｍ Ｌ．）是３個不同亞基因組形成的異源
國際基因組學大會在長春落幕
10月24日，2011國際基因組學大會在長春落幕。中科院院士賀林、美國國立衛生研究院癌癥研究所資深研究員Charles Vinson等國內外知名專家學者，圍繞“基因組學時代的機遇與挑戰”主題，從基因組科學、基因組技術、基因組信息學與計算生物學、基因組轉化與應用等方面進行了交流，并就全球基因
藥物基因組學發展和應用（三）
?藥物基因組學為臨床醫生和臨床藥師提供了很大程度上改善幾百萬患者藥物治療效果的機會。但是，這個機會的利用卻受到阻礙和挑戰，并且新的知識還在不斷的更新。? ? 藥物轉運體的基因多態性? ? 藥物的生物利用度不僅取決于藥物代謝酶的活性，在較大程度上也有賴于生物膜上轉運體的活性。轉運體分布在許多屏
藥物基因組學發展和應用【五】
藥物基因組學為臨床醫生和臨床藥師提供了很大程度上改善幾百萬患者藥物治療效果的機會。但是，這個機會的利用卻受到阻礙和挑戰，并且新的知識還在不斷的更新。? ? 藥物基因組學臨床應用的機遇與挑戰? ? 藥物反應個體差異的發現和遺傳機制的證實，為改變藥物治療模式提供了重要的理論依據。使傳統的“千人一
藥物基因組學發展和應用【二】
?藥物基因組學為臨床醫生和臨床藥師提供了很大程度上改善幾百萬患者藥物治療效果的機會。但是，這個機會的利用卻受到阻礙和挑戰，并且新的知識還在不斷的更新。? ? 藥物代謝酶的基因多態性? ? 一、I相代謝酶? ? 人類細胞色素P450（CYP459）超家族在諸多藥物的代謝中發揮著重要作用，CYP
基因組學出手助番茄復“味”
以《更好吃的番茄》為題，1月27日的《科學》雜志用封面報道介紹了中美科學家關于番茄風味改良的化學和遺傳學路線圖研究成果，同期刊發了兩國科學家合作的論文。與此同時，《自然》雜志也就此在線發表了亮點報道。 《科學》和《自然》雜志如此重視這小小番茄的原因在于，番茄既是一種非常受消費者歡迎的蔬菜，根
雜交稻基因組學研究獲進展
中科院上海生科院植物生理生態研究所韓斌院士課題組聯合中國水稻所楊仕華等團隊，在雜交稻基因組學及雜種優勢遺傳機制研究中獲重要進展，2月5日，相關成果在線發表于《自然—通訊》雜志。 據介紹，雜交水稻育種技術的成功是我國近幾十年來取得的一項重要科技成就。伴隨著汕優63、兩優培九等一大批高產雜交稻品種
雜交稻基因組學研究獲進展
中科院上海生科院植物生理生態研究所韓斌院士課題組聯合中國水稻所楊仕華等團隊，在雜交稻基因組學及雜種優勢遺傳機制研究中獲重要進展，2月5日，相關成果在線發表于《自然—通訊》雜志。 據介紹，雜交水稻育種技術的成功是我國近幾十年來取得的一項重要科技成就。伴隨著汕優63、兩優培九等一大批高產雜交稻品種
家犬基因組學研究獲新進展
科學界對于家犬的起源和馴化一直爭議不斷。近日，中科院院士張亞平帶領團隊發現，家犬中亞起源的假說與基于全基因組重測序數據分析的家犬東亞南部起源模式相沖突。相關成果日前在線發表于美國《國家科學院院刊》。 2015年，美國學者Shannon等人通過分析大量的家犬群體全基因組DNA芯片數據，提出了家犬
Nature發布比較基因組學研究重要發現
來自杜克大學醫學院、Brigham婦女醫院和哈佛醫學院的研究人員，發現了一個機制可以解釋：一些遺傳突變在一種基因組中會致病，而在另一種基因組中則為良性的原因。 在發表于6月29日《自然》（Nature）雜志上的研究論文中，研究人員比較了成千上萬的人類致病突變與大約100個動物物種的相似序列。
解決基因組學重要挑戰的新工具
單細胞基因組學和宏基因組學是開創性的技術，可幫助研究人員評估環境微生物群落的結構和功能。現在應用這些技術的項目越來越多，但是，仍缺乏一種高通量過程來檢查所組裝的基因組序列，從而阻礙了這些技術的廣泛應用。目前，去除已上傳到公共數據庫的微生物基因組中的污染序列，還是一個手動和耗時的過程，為了去除污染
基因組學將如何進入日常醫學？
隨著大規模的DNA結果越來越多的可供病人和保健提供者使用，醫學界在醞釀著一次平靜的轉換。在一連串的數據當中，醫生、顧問和家庭正在梳理如何更好地理解這些信息，并將其用于醫療決策的制定。 最近，在兩大兒科醫院舉行的臨床遺傳學會議上，來自多家機構的專家提出了他們對于“基因組整合到臨床實踐”的第一份建
Neogen農業基因組學解決方案（三）
豬的基因組學解決方案GeneSeek 的豬基因組學解決方案為窺探豬的遺傳結構打開了一個重要的窗口，包括是否易感染治療昂貴的疾病以及繁殖中對想要性狀的鎖定。GeneSeek豬全基因組低密度微珠芯片該微珠芯片提供約 10,000個 SNP，包括經常使用的 USDA血統和身份 SNP、用于識別品種的 SN