《科學》：基因組大規模篩選新技術助力癌癥研究
3000種基因經初次篩選后，大約24個符合要求 多年來生物學家一直在搜尋癌細胞的弱點，以期找到對付癌癥的線索。美國科學家近日研究出了一種基因組大規模篩選技術，有望提供一種強大的經濟有效的方法以挑選出對付癌癥的新藥靶。相關論文發表在2月1日的《科學》（Science）上。 2005年，美國國立衛生研究院斥資15億美元發起“癌癥基因組地圖”（TCGA）項目，目的是搜尋在很多癌癥中發生變異的基因。不過有很多科學家批評說，TCGA過分強調基因測序而忽視了功能性研究，而后者能夠確定哪種變異是最重要的。哈佛醫學院的遺傳學家Stephen Elledge就是持這種觀點的人之一。 在最新的研究中，Elledge和冷泉港實驗室的分子生物學家Gregory Hannon及同事一道，構建了新的病毒載體，每一個載體都含有一個RNA分子，用來關閉帶有補充序列的基因。載體還帶有DNA“條形碼”，這樣研究人員稍后就能確定哪......閱讀全文
《科學》：基因組大規模篩選新技術助力癌癥研究
3000種基因經初次篩選后，大約24個符合要求 ?多年來生物學家一直在搜尋癌細胞的弱點，以期找到對付癌癥的線索。美國科學家近日研究出了一種基因組大規模篩選技術，有望提供一種強大的經濟有效的方法以挑選出對付癌癥的新藥靶。相關論文發表在2月1日的《科學》（Science）上。?2005年，美國國立衛
科學家成功篩選出開發新型癌癥免疫療法的關鍵靶點
在過去10年里免疫療法給癌癥治療帶來了革命性的變革，然而很多腫瘤對這些新型療法并沒有反應，近日，來自耶魯大學的科學家們通過研究對T細胞中2萬個人類基因進行全基因組篩選，鑒別出了多個新型候選基因，其能促進機體免疫系統攻擊多種類型的腫瘤，相關研究結果刊登在國際雜志Cell上。圖片來源：Yale Un
科學家開發出新方法篩選新的癌癥藥物靶標
在一項新的研究中，來自美國達納-法伯癌癥研究所和波士頓兒童醫院癌癥與血液疾病中心等研究機構的研究人員開發出一種新的篩查方法，即利用CRISPR-Cas9基因組編輯技術在小鼠體內測試上千個腫瘤基因的功能。他們利用這種方法揭示出新的藥物靶標，從而可能潛在地改進PD-1檢查點抑制劑（一類新的有前景的癌
利用CRISPR系統篩選癌癥藥物靶向目標
近日，來自美國冷泉港實驗室的研究人員在國際學術期刊nature biotechnology在線發表了一項最新研究進展，他們應用CRISPR-CAS9技術靶向編碼蛋白功能性結構域的外顯子對癌癥藥物作用靶點進行大規模篩選，克服了CRISPR-CAS9技術在該方面的技術障礙，對于癌癥藥物靶點篩選有重要
國際癌癥基因組聯盟公布逾1萬個癌癥基因組數據
國際癌癥基因組聯盟(International Cancer Genome Consortium，簡稱"ICGC")近日向科研界公布了超過1萬個癌癥基因組的數據。這些數據能更好地幫助全世界的癌癥研究者從基因方面了解癌癥，加快對癌癥的研究并幫助更多癌癥靶向治療的發展。 安大略癌癥研究所所
Science專題：癌癥基因組學
在2001年完成人類基因組測序后，許多的研究人員立即將目光放到了利用這些信息來更好地了解遺傳學上。最近，越來越多的研究確定了表觀遺傳學在癌癥的發生、形成及發展過程中起效應。從鑒別與遺傳性癌癥相關的單基因變異的前基因組時代轉向，測序技術的進步使得研究人員能夠利用全基因組方法來檢測基因組間的差異，以
Nature公布800個癌癥基因組
來自癌癥基因組計劃的科學家們近期報告了他們最新的癌癥基因組研究成果，他們公布了800個乳腺癌的遺傳特征，包括發現了導致乳腺癌最常見的形式的遺傳原因，為新的治療靶點提供線索，并確定乳腺癌和卵巢癌一種亞型之間的分子遺傳相似性。 這項研究結果有助于更全面的了解每種乳腺癌亞型背后的分子機制，相關成
Cell年度綜述：癌癥基因組入選
Cell雜志創刊于1976年，現已成為世界自然科學研究領域最著名的期刊之一，并陸續發行了十幾種姊妹刊，在各自專業領域里均占據著舉足輕重的地位。近期Cell雜志盤點了2013年度最佳綜述及最佳論文，其中熱門技術CRISPR也登上了榜單，相關論文描述了利用基因調控系統 CRISPR/Cas，一步
科學家利用機器學習解開臨床癌癥樣本中的基因組密碼
分析癌癥基因組中的突變過程有助于在早期發現和準確診斷癌癥，并可以揭示某些癌癥患者對治療產生耐藥性的原因。 臨床癌癥樣本是一個巨大的資源，可以為分子診斷技術提供更全面的支持，使特定的癌癥患者與適合的癌癥療法相匹配，從而達到最好的治療效果。然而，由于臨床癌癥樣本中的DNA質量較差（如福爾馬林會對D
基因組文庫和cDNA文庫的構建及篩選
劉芝華 中國醫學科學院腫瘤研究所??分子腫瘤學國家重點實驗室?概念：?基因組文庫是含有某種生物體全部基因的隨機片段的重組DNA克隆群體；cDNA文庫是指含有所有重組cDNA的克隆群體。???基因組文庫：來源于基因組DNA，反映基因組的全部信息，用于基因組物理圖譜的構建，基因組序列分析，基因在染色體上
癌癥基因組——癌癥研究和云計算的里程碑
圖片來源：https://www.nature.com/articles/d41586-020-00308-w 2001年，人類基因組計劃完成，整個計劃花費約30億美元，1985年提出，1990年正式啟動，歷經十余年。腫瘤是最熱門的研究領域之一，該領域的研究者們一直希望可以借助測序手段去表征腫瘤的
試管嬰兒孕前基因篩選首次擴至癌癥
9月24日，我國生殖工程創始人之一、中南大學教授、中信湘雅生殖與遺傳專科醫院院長盧光琇在長沙宣布，她所在的研究團隊運用最新的胚胎植入前遺傳學診斷（PGD）技術，對一個家族性致癌基因在后代中的傳遞進行了排除，通過該技術誕生的國內首例“無癌寶寶”目前已滿半歲，隨訪顯示寶寶身體指標一切正常。據悉，這是
Nature對兒童癌癥基因組分析，有望實現兒童癌癥精準治療
在一項新的研究中，來自美國圣猶大兒童研究醫院等研究機構的研究人員證實患有癌癥的兒童和成年人通常具有不同的發生突變的基因來促進疾病產生，這提示著這些患者可能受益于不同的療法。這一發現強調了對兒童癌癥進行精準醫療的必要性。相關研究結果于2018年2月28日在線發表在Nature期刊上，論文標題為“P
Nature：99個癌癥基因組全面解析
近日來自美國、澳大利亞、加拿大的研究人員組成的一個國際研究小組報告了一項大規模胰腺癌基因組分析研究的結果，揭示了導致這一癌癥潛在突變的復雜性，發現了與之相關的兩條新信號途徑。這些信息將推動開發出胰腺癌的新早期診斷測試。相關論文在線發表在10月24日的《自然》(Nature)雜志上。 貝勒醫
基因組學:－跨越癌癥研究國界
1982年11月，在尼日利亞海軍醫院外足球場上踢球的一名軍官，突然摔倒死亡。這名男子被帶到急診室時，當時還是一個新人的 Olufunmilayo Funmi Olopade醫生正在值班。“我們搞不明白為什么他死亡，這讓我感到震驚，從那時開始我意識到，我需要做更多的工作來理解和幫助人們。”Ol
Nature新聞：讀取癌癥的基因組藍圖
在過去的10年里，人類基因組測序從劃時代的科學成果進入到了商業化的階段。新一代的測序(NGS)設備結合強有力的生物信息學使得研究人員常規概覽各種腫瘤類型扭曲及受損的基因組圖譜成為可能。相應地，公司、臨床研究團體和學術中心正競相將來自癌癥基因組學不斷增長的數據轉變為一些靶向性的、患者特異性的治療策
PNAS：探查癌癥基因組ncRNA“暗物質”
來自西奈山Icahn醫學院的研究人員在癌細胞中發現了一組可以激發免疫反應的非編碼RNA分子，它們具有與病原體相似的一些特征。由于這些分子在癌癥中表達并擴增，它們造成的免疫反應有可能影響了癌癥的生長。這項研究發布在《美國國家科學院院刊》（PNAS）上。 研究人員是通過探查基因組“暗物質”組成部分
癌癥基因組項目(TCGA)完成之反思
經過美國不懈的努力，涉及上萬個癌基因的癌基因組項目正式告一段落。該項目在2006年開始，預計花費1億美元進行研究，并且癌癥基因組圖譜（TCGA）現在已經成為國際癌癥基因組協會最大的組成部分，該項目匯聚了來自16個國家的科學家，并發現了接近10萬個與癌癥相關的基因突變。 現在的問題是，下一步怎么
Cell：癌癥基因組計劃再取重要成果
來自德克薩斯大學MD安德森癌癥中心的研究人員稱，他們將最致命的皮膚癌類型——黑色素瘤分為了4個不同的基因亞型，這一研究發現有可能會在尋求個體化醫療領域體現它的價值。這項研究是癌癥基因組圖譜計劃（TCGA）的一個組成部分，研究人員將他們的成果發布在6月18日的《細胞》（Cell）雜志上。 研究人
Cell新文章：癌癥全基因組測序
根據華盛頓大學醫學院的一項新研究，具有吸煙史的肺癌患者相比于不吸煙的肺癌患者腫瘤中的遺傳突變要多10倍。這一研究在線發表在9月13日的《細胞》(Cell)雜志上。 論文的資深作者、華盛頓大學基因組研究所主任Richard K. Wilson 說：“吸煙者基因組具有比不吸煙的肺癌患者基因
《Nature－Genetics》：癌癥的基因組結構研究
癌癥的基因組結構研究發表《Nature Genetics》 B細胞通過一系列精心控制的染色體重排和“良好”突變產生抗體，這些突變使細胞能夠產生大量不同的抗體。“盡管變化對產生大量多樣的抗體至關重要，但仍有可能發生‘壞’突變并導致B細胞源性癌癥，”研究負責人、哥倫比亞大學內科醫師和外科醫生學院微
納米藥物載體篩選中的基因組決定因素
納米粒子納米顆粒作為藥物載體具有多種治療優勢，如降低毒性、延長半衰期和改善藥物輸送，在臨床上應用越來越有前景。輝瑞和莫德納的mRNA疫苗均用到LNP納米顆粒載體。然而，眾多納米顆粒制劑具有不同的物理和生物學特性，并不容易看出在特定的疾病環境中哪種是最適合的。作者開發了一種高通量篩選方法，能夠系統地評
用大片段基因組－DNA－克隆直接篩選－cDNA實驗
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用大片段基因組－DNA－克隆直接篩選－cDNA實驗
試劑、試劑盒 擴增緩沖液DNA 聚合酶 DNaseI限制性內切核酸酶ATP鏈霉親和素-磁珠結合緩沖液T4DNA 連接酶熱穩定 DNA 聚合酶瓊脂糖凝膠BACDNA缺口平移緩沖液雜交液平末端 cDNACot1 基因組 DNA胞漿 poly(A)+RNAdNTP 溶液DNA 分子質量標志物寡
用大片段基因組－DNA－克隆直接篩選－cDNA實驗
本方案使用克隆在 BAC 載體上的一段 500kb 的人基因組 DNA 連續序列，直接篩選與其互補的的 cDNA。但本方法也可適用于任意大小的基因組靶 DNA。本實驗來源于分子克隆實驗指南（第三版）上冊，作者：黃培堂。試劑、試劑盒擴增緩沖液DNA 聚合酶 DNaseI限制性內切核酸酶ATP鏈霉親和素
科學家總結癌癥基因組學發展歷程，展望未來發展方向
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498613.shtm近日，北京大學生物醫學前沿創新中心主任、生命科學學院教授張澤民受邀全面總結了癌癥基因組學的發展歷程，展望了其未來發展方向。相關文章于4月13日發表于《細胞》。 ???刻畫腫瘤微
透過大規模基因組分析推出－泛癌癥圖譜－開啟癌癥治療
【Technews科技新報】美國國立衛生研究院（NIH）資助的研究團隊已經完成了一份詳細的基因組分析，這個被稱為泛癌癥圖譜（PanCancer Atlas）的研究結果收錄了 27 篇論文，并包含了 33 種癌癥、1 萬多個種不同腫瘤分子和臨床訊息的數據資料。 泛癌癥圖譜主要是針對癌癥基因組
Nature：CRISPR實施全基因組篩選鑒定腸道病菌感染靶標
10月20日Nature上刊登的一項研究用CRISPR實施全基因組篩選，鑒定了新興的威脅生命的胃腸道艱難梭菌（Clostridium difficile）感染的關鍵靶標。美國波士頓兒童醫院的Min Dong博士和Liang Tao博士領導的研究小組的工作揭示了這種細菌最強效的毒素如何進入細胞，這
大型研究為癌癥基因組分析奠定基礎
12月9日，國際癌癥基因組協會（ICGC）在著名的《Nature Communications》雜志，發表了一篇令人瞠目的文章，它為即將到來的癌癥基因組學研究時代，奠定了基礎。該項目，是由Centro Nacional de Analisis Genómico (CNAG-CRG)和German
數字PCR技術精確檢測癌癥基因組擴增
來自斯坦福大學以及Bio-Rad的研究人員證實，數字PCR系統能夠精確測定長期存放的癌組織樣本中的癌癥基因組擴增。該研究成果發表在《Translational Medicine》雜志上。 某些拷貝數變異(如基因組擴增)可能導致特定癌基因的過表達，推動癌癥發展。靶定擴增的癌基因有望實現癌